155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1694 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1694  permease  100 
 
 
358 aa  706    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  36.69 
 
 
300 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  35.08 
 
 
346 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  35.88 
 
 
288 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  35.53 
 
 
298 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  34.3 
 
 
288 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  33.76 
 
 
300 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  33.72 
 
 
341 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  32.23 
 
 
297 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  36.74 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  34.21 
 
 
343 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  34.21 
 
 
343 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  37.86 
 
 
298 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  32.33 
 
 
297 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  36.81 
 
 
324 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  35.36 
 
 
298 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  37.15 
 
 
325 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  35.36 
 
 
298 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  35.36 
 
 
298 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  35.36 
 
 
298 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  37.15 
 
 
325 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  35.36 
 
 
298 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  35.13 
 
 
298 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  35.36 
 
 
298 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  35.36 
 
 
298 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  36.11 
 
 
371 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  35.36 
 
 
298 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  35.45 
 
 
325 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  36.81 
 
 
324 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  31.96 
 
 
350 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  35.79 
 
 
325 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  32.68 
 
 
362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  35.49 
 
 
336 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  32.16 
 
 
350 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  34.81 
 
 
524 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  32.09 
 
 
312 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  32.58 
 
 
524 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  34.17 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  34.92 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  32.48 
 
 
332 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  31.69 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  36.08 
 
 
323 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  33.68 
 
 
342 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  35.24 
 
 
318 aa  112  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  29.74 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  29.74 
 
 
328 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  27.54 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  32.4 
 
 
334 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  30.13 
 
 
325 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  31.07 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  36.05 
 
 
365 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  31.87 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  31.01 
 
 
368 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  31.01 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  22.82 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  26.6 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  23.6 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  22.78 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  24.24 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  23.29 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  26.7 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  24.28 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  21.74 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  23.27 
 
 
368 aa  63.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  22.03 
 
 
306 aa  63.2  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  23.34 
 
 
451 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  22.51 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  22.69 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  23.91 
 
 
294 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  22.6 
 
 
316 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  23.89 
 
 
304 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  25.5 
 
 
350 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  24.82 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  23.76 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  23.38 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  25.7 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  21.17 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  20.16 
 
 
433 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  24.3 
 
 
363 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  19.95 
 
 
423 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25.1 
 
 
293 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  26.43 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  25.18 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  25.43 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  23.99 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  23.66 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  25 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  23.21 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  22.33 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  22.9 
 
 
296 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  24.39 
 
 
350 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  28.03 
 
 
378 aa  53.1  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  26.55 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  22.22 
 
 
367 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  23.65 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  23.84 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  25.74 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  21.86 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  22.66 
 
 
316 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>