195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2656 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2656  permease  100 
 
 
350 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  66.67 
 
 
343 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  59.52 
 
 
368 aa  328  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  61.31 
 
 
357 aa  325  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  65.31 
 
 
352 aa  292  7e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  48.19 
 
 
342 aa  281  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  56.08 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  52.48 
 
 
332 aa  248  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  30.88 
 
 
300 aa  160  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  33.11 
 
 
346 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  29.69 
 
 
297 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  29.69 
 
 
297 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  35.06 
 
 
524 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  30.42 
 
 
312 aa  146  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  34.47 
 
 
298 aa  146  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  30.68 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  32.86 
 
 
300 aa  145  9e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  36.26 
 
 
298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  35.21 
 
 
288 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  35.88 
 
 
298 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  35.5 
 
 
298 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  30.3 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  35.5 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  35.5 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  35.5 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  35.5 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  35.5 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  35.5 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  35.5 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  30.98 
 
 
341 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  33.57 
 
 
288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  31.45 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  31.45 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  29.92 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  30.3 
 
 
325 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  30.3 
 
 
325 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  30.3 
 
 
324 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  29.92 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  30.36 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  34.44 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  30.64 
 
 
524 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  29.41 
 
 
350 aa  126  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  28.97 
 
 
350 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  31.39 
 
 
358 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  33.69 
 
 
318 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  28.46 
 
 
364 aa  96.7  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  34.3 
 
 
318 aa  96.7  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  38.17 
 
 
362 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  27.43 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  34.59 
 
 
323 aa  90.1  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  27.08 
 
 
328 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  25.08 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  45.92 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  26.53 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  28.52 
 
 
620 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  47.57 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  30.77 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  23.69 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  24.92 
 
 
293 aa  69.3  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  27.55 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  27.46 
 
 
307 aa  67  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  25.89 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  29.2 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  22.54 
 
 
365 aa  62.8  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.55 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  26.89 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  25.94 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  29.17 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  29.2 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  25.66 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  25.66 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  29.56 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  28.57 
 
 
358 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  28.57 
 
 
358 aa  57.4  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  26.19 
 
 
358 aa  57  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  24.16 
 
 
368 aa  56.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  40.48 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  25.33 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  26.42 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  26.5 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  20.11 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  27.17 
 
 
319 aa  53.9  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  24.73 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  39.29 
 
 
351 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  21.59 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  27.32 
 
 
433 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  26.36 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  30.53 
 
 
461 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  31.3 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  22.4 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  31.25 
 
 
451 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  35.56 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  31.5 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  30.21 
 
 
341 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  32.48 
 
 
489 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  31.43 
 
 
317 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  30.86 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  31.82 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  30.22 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>