213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1901 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  100 
 
 
298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  100 
 
 
298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  100 
 
 
298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  99.66 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  99.66 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  98.99 
 
 
298 aa  598  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  98.32 
 
 
298 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  94.97 
 
 
298 aa  559  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  61.54 
 
 
288 aa  345  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  54.55 
 
 
288 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  50.89 
 
 
300 aa  288  6e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  48.95 
 
 
300 aa  277  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  45.94 
 
 
371 aa  269  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  45.58 
 
 
325 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  44.88 
 
 
325 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  44.72 
 
 
324 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  44.88 
 
 
324 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  44.01 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  44.01 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  42.38 
 
 
346 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  35.19 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  35.19 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  34.68 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  35.27 
 
 
297 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  34.1 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  34.06 
 
 
350 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  38.38 
 
 
312 aa  189  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  37.13 
 
 
524 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  32.82 
 
 
350 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  35.2 
 
 
341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  39.46 
 
 
342 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  35.39 
 
 
358 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  32.82 
 
 
336 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  32.57 
 
 
524 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  34.25 
 
 
370 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  38.31 
 
 
352 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  38.08 
 
 
332 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  36.64 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  36.49 
 
 
343 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  29.43 
 
 
364 aa  135  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  35.23 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  36.68 
 
 
368 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  36.17 
 
 
357 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  32.21 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  30.2 
 
 
318 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  28.52 
 
 
328 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  30.32 
 
 
323 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  28.19 
 
 
328 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  37.74 
 
 
362 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  30.87 
 
 
318 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  37.59 
 
 
365 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.47 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  23.91 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  25.44 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  30.77 
 
 
402 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  24.26 
 
 
620 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  21.21 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  26.35 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  23.4 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  24.65 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  28.4 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  22.11 
 
 
358 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  27.46 
 
 
389 aa  65.1  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  22.78 
 
 
633 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25.63 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  28.47 
 
 
423 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  23.02 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  28.47 
 
 
461 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  22.43 
 
 
311 aa  63.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  21.4 
 
 
368 aa  62.8  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  22.64 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  28.36 
 
 
490 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  26.21 
 
 
378 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  22.79 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  23.17 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  26.28 
 
 
474 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  23.13 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  22.14 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  25.31 
 
 
611 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  23.53 
 
 
475 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  29.85 
 
 
356 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  23.23 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  23.44 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  23.65 
 
 
451 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  27.42 
 
 
393 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  26.24 
 
 
389 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  28.17 
 
 
433 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  26.24 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  24.22 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  23.71 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  22.74 
 
 
362 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  20.7 
 
 
365 aa  56.6  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  25.53 
 
 
461 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  29.51 
 
 
390 aa  55.8  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  25.26 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  23.46 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  23.05 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>