92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5330 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5330  permease  100 
 
 		 332 aa  630  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  53.11 
 
 		 342 aa  299  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  56.04 
 
 		 334 aa  288  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  52.96 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  55.22 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  52.48 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  49.65 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  50.35 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  36.11 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  37.46 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  34.08 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  37.55 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  37.55 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  37.55 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  37.55 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  37.55 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  37.55 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  37.55 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  37.55 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  37.55 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  37.16 
 
 		 298 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  30.07 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  34.83 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  33.57 
 
 		 524 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  30.42 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  33.71 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  29.91 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  31.12 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  31.12 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  29.92 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  30.04 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  32.85 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  27.44 
 
 		 524 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  28.9 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  28.9 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  29.17 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  27.96 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  27.96 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  29.17 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  29.3 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  31.38 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  31.25 
 
 		 358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  29.8 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  27.71 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  41.41 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  32.81 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  29.59 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  41.94 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  29.74 
 
 		 364 aa  97.1  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  44.83 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  32.82 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  25.08 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  25.08 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  25.33 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  25.86 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  46 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  25.32 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  24.16 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  21.59 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  26.37 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  25.41 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25.18 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  27.08 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  30.6 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  23.69 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  24.25 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  23.86 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  26.52 
 
 		 620 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  21.28 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  23.83 
 
 		 363 aa  49.3  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  28.19 
 
 		 475 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  32 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  28.1 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  20.32 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  22.46 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  26.03 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  28.57 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  25.27 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  22.18 
 
 		 284 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  24.35 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  26.58 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  28.39 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  20.72 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  24.06 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  25.17 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  23.29 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  20 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  39.76 
 
 		 373 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  24.26 
 
 		 367 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  19.46 
 
 		 332 aa  42.7  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  19.23 
 
 		 316 aa  42.7  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  24.03 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>