55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4253 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014159  Tpau_4253  permease  100 
 
 		 342 aa  639    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  33.98 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  37.99 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  35.67 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  35.84 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  36.01 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  32.62 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  26.95 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  26.94 
 
 		 524 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  34.41 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  29.14 
 
 		 288 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  27.86 
 
 		 298 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  27.5 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  26.12 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  22.92 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  23.43 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  27.21 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  27.14 
 
 		 298 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  27.14 
 
 		 298 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  27.14 
 
 		 298 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  27.14 
 
 		 298 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  27.14 
 
 		 298 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  27.14 
 
 		 298 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  27.14 
 
 		 298 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  33.94 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  25.59 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  24.47 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  26.64 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  23.51 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  27.81 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  24.44 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  27.14 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  24.11 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  23.24 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  22.13 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  23.24 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  23.71 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  25.46 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  23.53 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  22.88 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  33.59 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  35.54 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  37.25 
 
 		 365 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  27.91 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  27.8 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  21.47 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  26.61 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  28.35 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  28.35 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  26.61 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  26.61 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  28.28 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  26.15 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  27.48 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  37.5 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>