200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0729 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 300 aa  594  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  69.67 
 
 		 300 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  48.45 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  51.25 
 
 		 298 aa  275  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  51.25 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  51.25 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  51.25 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  51.25 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  51.25 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  51.25 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  51.25 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  51.25 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  51.25 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  48.44 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  47.16 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  41.94 
 
 		 346 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  36.33 
 
 		 371 aa  205  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  37.28 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  36.92 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  35.97 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  35.97 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  36.56 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  36.56 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  34.98 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  34.97 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  30.46 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  30.46 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  35 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  30.03 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  29.1 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  32.01 
 
 		 350 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  31.16 
 
 		 524 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  35.57 
 
 		 358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  32.88 
 
 		 524 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  30.86 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  32.64 
 
 		 342 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  31.3 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  30.77 
 
 		 336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  30.85 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  34.59 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  32.98 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  33.33 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  31.34 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  30.88 
 
 		 350 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  31.74 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  29.25 
 
 		 357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  29.64 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  32.16 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  28.96 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  29.15 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  30.24 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  32.14 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  32.66 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  33.83 
 
 		 365 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.75 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  24.56 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  21.84 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  24.91 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  22.89 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  24.52 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  22.76 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  21.43 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25.2 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  24.26 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  21.72 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  22.39 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  25.71 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  21.53 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  25.9 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  23.36 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  26.92 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  21.58 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  23.85 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  24.13 
 
 		 620 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  21.31 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  22.39 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  22.73 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  23.89 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  22.47 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  23.42 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  21.38 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  31.82 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  19.92 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  23.02 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  21.64 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  21.82 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  23.02 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  21.79 
 
 		 352 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.49 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  22.11 
 
 		 633 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  23.21 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  21.19 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  20.44 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  22.53 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  20.86 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  21.67 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  21.67 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  22.61 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  22.3 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  25.12 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>