More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0047 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0047  permease  100 
 
 		 524 aa  1059    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  33.4 
 
 		 524 aa  259  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  43.79 
 
 		 312 aa  226  8e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  37.72 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  38.18 
 
 		 297 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  38.18 
 
 		 297 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  39.16 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  39.08 
 
 		 325 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  38.38 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  38.68 
 
 		 324 aa  183  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  38.81 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  38.46 
 
 		 324 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  38.81 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  38.23 
 
 		 288 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  35.31 
 
 		 346 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  36.17 
 
 		 288 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  34.71 
 
 		 298 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  33.82 
 
 		 300 aa  160  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  33.57 
 
 		 300 aa  155  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  33.94 
 
 		 350 aa  153  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  34.51 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  34.15 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  34.51 
 
 		 298 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  34.15 
 
 		 298 aa  151  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  34.15 
 
 		 298 aa  151  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  34.15 
 
 		 298 aa  151  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  34.15 
 
 		 298 aa  151  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  34.15 
 
 		 298 aa  151  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  34.15 
 
 		 298 aa  151  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  34.15 
 
 		 298 aa  151  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  34.28 
 
 		 350 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  32.23 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  32.23 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  35.36 
 
 		 334 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  34 
 
 		 358 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  32.92 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  29.97 
 
 		 341 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  33.99 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  27.62 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  33.57 
 
 		 332 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  31.93 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  32.08 
 
 		 336 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  32.34 
 
 		 350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  28.65 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  34.52 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  32.87 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  35.93 
 
 		 365 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  34.81 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  30.77 
 
 		 318 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  28.08 
 
 		 328 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  28.08 
 
 		 328 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  28.91 
 
 		 325 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  31.15 
 
 		 323 aa  93.2  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  31.27 
 
 		 318 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  22.87 
 
 		 402 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  24.32 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  27.9 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  25.08 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  22.83 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  29.32 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  25.56 
 
 		 620 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  23.19 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  23.41 
 
 		 304 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  30.12 
 
 		 318 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  21.74 
 
 		 294 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  23.44 
 
 		 358 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  34.44 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  25.55 
 
 		 451 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  31.41 
 
 		 330 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  30.53 
 
 		 366 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  24.29 
 
 		 293 aa  53.9  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  25.23 
 
 		 323 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  25.23 
 
 		 323 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  31.48 
 
 		 377 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  24.62 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  30.25 
 
 		 367 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  29.19 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2882  G3E family GTPase-like protein  26.32 
 
 		 318 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000684528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  30.65 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.18 
 
 		 337 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  27.07 
 
 		 395 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  23.13 
 
 		 350 aa  52.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  30.6 
 
 		 306 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  25.6 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15320  cobalamin synthesis protein P47K  26.76 
 
 		 305 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  26.92 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  27.71 
 
 		 318 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  27.96 
 
 		 346 aa  51.2  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  26.54 
 
 		 322 aa  51.2  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  29.63 
 
 		 363 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  26.06 
 
 		 365 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  26.64 
 
 		 362 aa  51.6  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  23.92 
 
 		 323 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  22.22 
 
 		 316 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  31.62 
 
 		 346 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  31.62 
 
 		 346 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  31.62 
 
 		 346 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  31.62 
 
 		 346 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  31.62 
 
 		 346 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  31.62 
 
 		 346 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>