74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0263 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0263  permease  100 
 
 
328 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  99.39 
 
 
328 aa  637    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  57.32 
 
 
325 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  42.51 
 
 
336 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  40.65 
 
 
335 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  37.89 
 
 
343 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  37.89 
 
 
343 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  38.28 
 
 
350 aa  215  9e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  36.99 
 
 
341 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  38.75 
 
 
350 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  36.84 
 
 
362 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  28.25 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  28.21 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  29.75 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  33.66 
 
 
318 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  28.2 
 
 
298 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  28.47 
 
 
298 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  32.82 
 
 
323 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  28.14 
 
 
298 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  28.14 
 
 
298 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  28.14 
 
 
298 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  28.14 
 
 
298 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  28.14 
 
 
298 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  28.14 
 
 
298 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  28.14 
 
 
298 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  28.14 
 
 
298 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  31.25 
 
 
318 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  29.1 
 
 
524 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  25.81 
 
 
288 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  25.91 
 
 
312 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  29.49 
 
 
298 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  24.76 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  24.52 
 
 
297 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  24.75 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  28.4 
 
 
358 aa  92.8  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  28.08 
 
 
334 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  25.17 
 
 
325 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  24.83 
 
 
325 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  25.17 
 
 
325 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  24.5 
 
 
325 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  23.59 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  24.83 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  24.83 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  25.41 
 
 
524 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  24.91 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  25.34 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  22.88 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  26.69 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  25.08 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  36.45 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  28.08 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  26.13 
 
 
350 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  25.44 
 
 
368 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  26.13 
 
 
352 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  24.6 
 
 
352 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  22.92 
 
 
402 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  27.72 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  25.55 
 
 
633 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.5 
 
 
315 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  22.71 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  25.74 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  24.37 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  33.85 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  24.09 
 
 
611 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  22.17 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  21.03 
 
 
338 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  20.28 
 
 
336 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  24.43 
 
 
451 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  28.07 
 
 
406 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  20.85 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  22.4 
 
 
358 aa  42.7  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  25.71 
 
 
302 aa  42.7  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  26.06 
 
 
294 aa  42.4  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.26 
 
 
356 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>