118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3199 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3199  permease  100 
 
 		 370 aa  734    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  36.62 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  36.62 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  36.49 
 
 		 324 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  36.49 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  36.49 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  36.18 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  35.84 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  31.56 
 
 		 297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  33.78 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  31.56 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  33.23 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  31.73 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  32.19 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  34.55 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  32.35 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  32.76 
 
 		 288 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  33.82 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  33.82 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  33.82 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  33.82 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  33.82 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  33.82 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  33.82 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  33.82 
 
 		 298 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  33.82 
 
 		 298 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  32.74 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  31.32 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  31.21 
 
 		 524 aa  143  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  32.61 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  32.61 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  34.36 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  32.48 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  29.58 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  31.93 
 
 		 524 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  31.01 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  32.51 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  31.99 
 
 		 357 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  28.88 
 
 		 350 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  29.62 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  31.32 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  31.54 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  30.36 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  30.97 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  32.28 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  30.18 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  31.13 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  31.94 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  36.99 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  42.61 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  32.23 
 
 		 318 aa  93.6  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  26.8 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  24.91 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  24.57 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  24.19 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  24.83 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  24.84 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  25.53 
 
 		 620 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  23.92 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  23.37 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  22.32 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.71 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  20.9 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  33.85 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  20.71 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  24.33 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  33.08 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  22.87 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  32.58 
 
 		 474 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  22.45 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  21.28 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  33.33 
 
 		 433 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  24.65 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  25.7 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  34.68 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  21.38 
 
 		 611 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  22.09 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  25.12 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  22.09 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  25.26 
 
 		 366 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  21.66 
 
 		 633 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  26.54 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  24.2 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  23.29 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  26.44 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  32.26 
 
 		 490 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  22.81 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  31.03 
 
 		 509 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  22.27 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  23.15 
 
 		 345 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  23.15 
 
 		 345 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  24.43 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  36.21 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  24.29 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  22.37 
 
 		 307 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  24.69 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  28.3 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  33.08 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  33.33 
 
 		 510 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  25.81 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>