157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3005 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3005  permease  100 
 
 		 524 aa  1057    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  33.4 
 
 		 524 aa  259  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  42.25 
 
 		 312 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  37.14 
 
 		 325 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  37.37 
 
 		 325 aa  190  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  37.37 
 
 		 325 aa  190  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  35.29 
 
 		 371 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  37.02 
 
 		 324 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  37.02 
 
 		 324 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  37.86 
 
 		 297 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  37.54 
 
 		 297 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  35.99 
 
 		 288 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  35.71 
 
 		 325 aa  183  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  34.46 
 
 		 346 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  35.4 
 
 		 298 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  37.04 
 
 		 298 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  34.62 
 
 		 288 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  37.04 
 
 		 298 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  37.04 
 
 		 298 aa  171  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  37.04 
 
 		 298 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  37.04 
 
 		 298 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  37.04 
 
 		 298 aa  171  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  37.04 
 
 		 298 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  36.67 
 
 		 298 aa  171  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  37.04 
 
 		 298 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  37.04 
 
 		 298 aa  171  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  31.99 
 
 		 300 aa  164  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  31.25 
 
 		 300 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  33 
 
 		 364 aa  162  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  30.89 
 
 		 350 aa  150  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  30.67 
 
 		 335 aa  150  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  27.55 
 
 		 343 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  27.55 
 
 		 343 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  29.72 
 
 		 341 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  31.21 
 
 		 370 aa  144  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  32.26 
 
 		 358 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  29.29 
 
 		 350 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2882  G3E family GTPase-like protein  40.46 
 
 		 318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000684528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  28.85 
 
 		 336 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  26.42 
 
 		 342 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  27.44 
 
 		 332 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  28.04 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  28.47 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  37.78 
 
 		 362 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  29.73 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  30.56 
 
 		 357 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  28.06 
 
 		 325 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  25.77 
 
 		 318 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  26.98 
 
 		 352 aa  97.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  27.34 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  25.17 
 
 		 328 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  30 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  33.63 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  24.83 
 
 		 328 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  29.41 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  24.8 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0043  hypothetical protein  32.76 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  24.22 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0044  hypothetical protein  31.79 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.61 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  23.59 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  22.83 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2236  permease  22.97 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  24.73 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  20.88 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  23.78 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  32.2 
 
 		 317 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  25.68 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  23.28 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  30.11 
 
 		 360 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  27.23 
 
 		 345 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  26.27 
 
 		 350 aa  54.7  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  28.65 
 
 		 308 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  24.44 
 
 		 311 aa  53.9  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  53.9  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  22.41 
 
 		 294 aa  53.5  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  28.11 
 
 		 308 aa  53.5  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  23.81 
 
 		 352 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  32.5 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  24.84 
 
 		 345 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  27.45 
 
 		 381 aa  51.2  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  31.82 
 
 		 353 aa  50.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  27.33 
 
 		 318 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  22.71 
 
 		 301 aa  50.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  23.61 
 
 		 315 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  25.86 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  29.17 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  23.74 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  28.18 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  26.92 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  26.67 
 
 		 307 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  25.14 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  25.69 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  21.77 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  22.19 
 
 		 620 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  31.43 
 
 		 323 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  26.7 
 
 		 307 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  28.18 
 
 		 315 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  22.22 
 
 		 293 aa  48.5  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  24.4 
 
 		 331 aa  48.5  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>