212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1518 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1518  permease  100 
 
 		 288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  72.57 
 
 		 288 aa  424  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  61.19 
 
 		 298 aa  348  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  62.24 
 
 		 298 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  61.54 
 
 		 298 aa  335  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  61.54 
 
 		 298 aa  335  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  61.54 
 
 		 298 aa  335  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  61.54 
 
 		 298 aa  335  5e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  61.54 
 
 		 298 aa  335  5e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  61.54 
 
 		 298 aa  335  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  61.54 
 
 		 298 aa  335  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  61.54 
 
 		 298 aa  335  5e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  61.54 
 
 		 298 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  50 
 
 		 300 aa  278  6e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  51.69 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  45.74 
 
 		 371 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  46.74 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  46.72 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  45.04 
 
 		 324 aa  255  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  45.04 
 
 		 324 aa  254  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  44.33 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  44.33 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  43.94 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  38.85 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  38.85 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  35.89 
 
 		 335 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  34.36 
 
 		 343 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  34.36 
 
 		 343 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  38.16 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  33.43 
 
 		 350 aa  181  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  36.17 
 
 		 524 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  38.69 
 
 		 358 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  34.05 
 
 		 350 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  34.62 
 
 		 524 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  34.25 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  33.53 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  37.79 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  32.76 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  34.62 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  32.43 
 
 		 364 aa  145  8.000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  34.83 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  35.31 
 
 		 343 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  35.96 
 
 		 368 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  43.51 
 
 		 362 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  35.84 
 
 		 357 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  32.94 
 
 		 325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  33.57 
 
 		 350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  33.86 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  35.45 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  28.14 
 
 		 328 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  27.8 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  33.07 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  34.97 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  33.33 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  23.65 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  23.34 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  21.77 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  27.53 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  21.45 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  22.11 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  22.26 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  24.32 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  25.55 
 
 		 620 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  21.05 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.2 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  24.56 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  23.51 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  26.28 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  28.57 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  26.21 
 
 		 474 aa  62.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  22.83 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  21.62 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  34.31 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  26.9 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  29.58 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  28.8 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  25.76 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  28.36 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  24.65 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  24.62 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  27.07 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  25 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  22.3 
 
 		 633 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  30.91 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  23.35 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  27.07 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  27.69 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  29.92 
 
 		 390 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  28.23 
 
 		 393 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  26.62 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  22.18 
 
 		 611 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  21.96 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  23.94 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  22.34 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  22.87 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  23.45 
 
 		 475 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  25.87 
 
 		 389 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  28.35 
 
 		 461 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  21.32 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  29.31 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>