227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1485 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1485  permease  100 
 
 		 393 aa  775    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  72.56 
 
 		 392 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  72.56 
 
 		 389 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  62.53 
 
 		 390 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  66.84 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0753  permease  61.88 
 
 		 389 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  61.73 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  57.84 
 
 		 389 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  53.69 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  52.06 
 
 		 437 aa  411  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  54.23 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  47.01 
 
 		 361 aa  332  8e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  46.61 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  45.69 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  49.58 
 
 		 343 aa  311  2e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  45.76 
 
 		 347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  48.06 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  48.43 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  44.38 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1899  permease  49.58 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  44.6 
 
 		 350 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  46.29 
 
 		 359 aa  270  4e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  40.96 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0893  permease  47.58 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  41.98 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  45.08 
 
 		 359 aa  242  9e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  42.01 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  41.4 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0701  permease  48.98 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  25.51 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1936  putative permease  57.95 
 
 		 111 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0118434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  24.65 
 
 		 356 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  23.32 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  24.86 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  25.3 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  21.49 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  23.21 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  22.89 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  24.63 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  24.27 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  22.62 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  22.6 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  23.81 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  23.26 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  23.81 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  24.01 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  21.22 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  23.51 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  23.99 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  24.65 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  22.88 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  21.41 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  24.02 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  22.55 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  23.71 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  23.1 
 
 		 331 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  23.08 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  25.35 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  22.6 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  23.82 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  23.55 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  33.95 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  22.28 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  23.65 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  22.52 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  24.22 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  23.74 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.23 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  22.8 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  25.07 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  23.03 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  23.18 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  21.85 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  24.27 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  23.38 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  23.55 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  24.23 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  23.66 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  23.17 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  23.17 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  24.53 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  20.49 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  23.23 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  24.29 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  23.5 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  23.94 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  21.41 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  22.92 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  22.15 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  22.15 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  21.87 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  22.44 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  23.94 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  22.15 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  22.87 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  22.29 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  23.76 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  26.38 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  23.8 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  23.76 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>