216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0187 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  100 
 
 		 343 aa  654    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  66.67 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  63.64 
 
 		 357 aa  340  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  60.78 
 
 		 368 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  65.58 
 
 		 352 aa  302  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  61.22 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  49.85 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  52.96 
 
 		 332 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  29.45 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  29.45 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  31.97 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  36.14 
 
 		 298 aa  153  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  32.87 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  31.54 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  31.82 
 
 		 524 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  34.78 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  31.07 
 
 		 371 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  31.18 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  31.43 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  36.97 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  31.43 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  32.13 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  37.69 
 
 		 298 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  30.82 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  36.92 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  30.82 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  36.64 
 
 		 298 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  36.26 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  36.26 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  36.26 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  36.26 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  36.26 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  36.26 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  36.26 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  35.31 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  32.51 
 
 		 370 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  32.75 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  27.86 
 
 		 524 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  31.99 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  32.55 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  32.55 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  37.15 
 
 		 288 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  33.23 
 
 		 336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  29.78 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  30.86 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  32.79 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  28.84 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  41.22 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  36.79 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  27.18 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  43.36 
 
 		 323 aa  93.2  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4253  permease  33.33 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261414  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  26.83 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  44.44 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  26.51 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  25 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  25.17 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  24.58 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  27.59 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  31.07 
 
 		 620 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  26.49 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  24.92 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  29.03 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  23.9 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  24.59 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  29.73 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  39.33 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  22.26 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  28.43 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  25.9 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  38.1 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  33.33 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  24.42 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  24.9 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  21.6 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  26.24 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  25 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  28.81 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  34.95 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  33.64 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  21.01 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  39.29 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  29.29 
 
 		 433 aa  53.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  30.56 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  39.29 
 
 		 351 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  28.2 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  31.96 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  30.53 
 
 		 474 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  31.76 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  31.21 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  34.86 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  26.79 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  29.01 
 
 		 423 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  21.91 
 
 		 406 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  29.91 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  33.33 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  30.47 
 
 		 490 aa  49.7  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  27.72 
 
 		 350 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4731  putative transporter  38.1 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.908679  normal  0.675732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>