28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0169 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0169  YHS domain protein  100 
 
 		 103 aa  217  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 861 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  54.76 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2411  YHS domain protein  45.83 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  43.48 
 
 		 463 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 786 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0461  YHS domain protein  46.34 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239375  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  46.94 
 
 		 818 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  35.53 
 
 		 846 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  48.78 
 
 		 55 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0904  YHS domain-containing protein  47.62 
 
 		 47 aa  42.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  52.27 
 
 		 868 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 		 796 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 928 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1872  YHS domain-containing protein  42.86 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  47.62 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  44 
 
 		 895 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  40.91 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0132  YHS domain protein  44.19 
 
 		 49 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  43.48 
 
 		 466 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1206  YHS domain-containing protein  52.38 
 
 		 56 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0706956  normal  0.966516 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  31.33 
 
 		 804 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 831 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  40.48 
 
 		 295 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 788 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  40.43 
 
 		 776 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 737 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 801 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>