105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0132 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0132  YHS domain protein  100 
 
 
49 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  78.26 
 
 
48 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0904  YHS domain-containing protein  73.33 
 
 
47 aa  77  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1872  YHS domain-containing protein  71.11 
 
 
49 aa  77  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  65.12 
 
 
861 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  56.82 
 
 
823 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  56.82 
 
 
809 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  54.55 
 
 
799 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2411  YHS domain protein  54.17 
 
 
56 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 
794 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  57.14 
 
 
973 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  52.17 
 
 
841 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
806 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  46.81 
 
 
372 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
801 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  43.48 
 
 
928 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  48.84 
 
 
804 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2219  hypothetical protein  59.52 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.221281  normal  0.0750414 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  55.56 
 
 
57 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
793 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  47.83 
 
 
841 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
831 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  51.16 
 
 
773 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0020  YHS domain-containing protein  51.02 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1579  YHS domain protein  54.35 
 
 
48 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 
895 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
818 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 
796 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  53.85 
 
 
755 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
908 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
795 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
1020 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 
781 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  48.98 
 
 
737 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1206  YHS domain-containing protein  53.33 
 
 
56 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0706956  normal  0.966516 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
788 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  50 
 
 
301 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
846 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
868 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  42.5 
 
 
441 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 
833 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  47.73 
 
 
786 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  40 
 
 
821 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  55.81 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1441  YHS domain-containing protein  53.49 
 
 
56 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0620316  normal  0.0208977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1146  YHS domain protein  45.65 
 
 
59 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0140786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  44.19 
 
 
353 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
811 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  45.24 
 
 
805 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  53.49 
 
 
55 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  51.16 
 
 
786 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  51.16 
 
 
786 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0461  YHS domain protein  46.67 
 
 
56 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  36.96 
 
 
787 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0605  hypothetical protein  44.19 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
786 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  43.18 
 
 
767 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  45.24 
 
 
796 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2261  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  55 
 
 
389 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  48.84 
 
 
466 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
783 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  48.78 
 
 
902 aa  48.9  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  45.24 
 
 
765 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  48.65 
 
 
299 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
826 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  51.16 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
846 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  37.78 
 
 
804 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
817 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
817 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 
776 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
836 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
801 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0881  coenzyme F420 hydrogenase, beta subunit  51.28 
 
 
387 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
787 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  48.72 
 
 
814 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0035  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.53 
 
 
346 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168888 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
797 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
810 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  44.44 
 
 
354 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 
778 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
835 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  37.78 
 
 
785 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
831 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
807 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
809 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 
798 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 
777 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
842 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
842 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
842 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
842 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
842 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
826 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
772 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
792 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
782 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1013  YHS domain protein  38.64 
 
 
282 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0169  YHS domain protein  44.19 
 
 
103 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
816 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>