120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0491 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  100 
 
 
55 aa  115  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0461  YHS domain protein  69.09 
 
 
56 aa  90.1  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239375  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  65.38 
 
 
56 aa  78.2  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  70.37 
 
 
57 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1206  YHS domain-containing protein  67.92 
 
 
56 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0706956  normal  0.966516 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1441  YHS domain-containing protein  66.04 
 
 
56 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0620316  normal  0.0208977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  45.28 
 
 
787 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
776 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
861 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0904  YHS domain-containing protein  61.36 
 
 
47 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1872  YHS domain-containing protein  60 
 
 
49 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  57.78 
 
 
767 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
796 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  43.33 
 
 
804 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  49.06 
 
 
836 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.283973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  45.83 
 
 
778 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  50.91 
 
 
846 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 
798 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
831 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 
782 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 
1020 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  44.19 
 
 
295 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 
777 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
797 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  41.51 
 
 
796 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  45.1 
 
 
793 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
816 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  51.16 
 
 
786 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
868 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  51.11 
 
 
973 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  44.07 
 
 
818 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1579  YHS domain protein  59.09 
 
 
48 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  51.16 
 
 
809 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
835 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  45.1 
 
 
788 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  53.33 
 
 
895 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 
823 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
794 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  41.51 
 
 
801 aa  50.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4130  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
799 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0132  YHS domain protein  53.49 
 
 
49 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
833 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  43.18 
 
 
805 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2189  conserved hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 
772 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
908 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  43.1 
 
 
737 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  51.16 
 
 
795 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
810 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  42.11 
 
 
821 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  50 
 
 
902 aa  50.1  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
826 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2922  copper-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
928 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0854901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
837 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 
841 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  51.16 
 
 
48 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  46.34 
 
 
826 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  44.23 
 
 
841 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
786 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 
811 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
787 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1376  hypothetical protein  44.44 
 
 
354 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.403864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  51.28 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  52.38 
 
 
441 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
786 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0605  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2219  hypothetical protein  55.81 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.221281  normal  0.0750414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0506  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
807 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
781 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  47.27 
 
 
846 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
809 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
842 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
842 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0311  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
842 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
842 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
842 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2411  YHS domain protein  46.67 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  46.34 
 
 
806 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.75515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  45.65 
 
 
806 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  43.14 
 
 
804 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0911  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
831 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
773 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  41.51 
 
 
765 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
787 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 
817 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 
817 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 
814 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  43.48 
 
 
466 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0283  copper-translocating P-type ATPase  39.22 
 
 
807 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2150  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  45.45 
 
 
353 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1146  YHS domain protein  52.27 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0140786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0030  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
791 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000836932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0020  YHS domain-containing protein  46.81 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0029  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
795 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.747408  normal  0.269109 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  40.35 
 
 
801 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5288  protein of unknown function DUF182  44.19 
 
 
372 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0031  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
838 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3657  YHS domain-containing protein  48.72 
 
 
213 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  43.9 
 
 
463 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2261  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  40.91 
 
 
389 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>