66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0295 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  100 
 
 		 84 aa  175  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  41.86 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  41.18 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  39.02 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  31.71 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  32.93 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  32.26 
 
 		 787 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1968  TRASH  30.86 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0491  YHS domain-containing protein  51.28 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  34.57 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 778 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  43.9 
 
 		 861 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 798 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2487  TRASH domain-containing protein  32.95 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  48.78 
 
 		 463 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  39.02 
 
 		 810 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1206  YHS domain-containing protein  50 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0706956  normal  0.966516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 		 835 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0726  YHS domain-containing protein  47.62 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000403997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0605  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 		 796 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0461  YHS domain protein  48.72 
 
 		 56 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239375  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1252  YHS domain-containing protein  46.51 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000672001 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 		 777 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2186  protein of unknown function DUF182  38.46 
 
 		 295 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  43.9 
 
 		 767 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 776 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2411  YHS domain protein  39.53 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2275  YHS  42.86 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  42.5 
 
 		 837 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1579  YHS domain protein  45.24 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0029  copper-translocating P-type ATPase  38.64 
 
 		 795 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.747408  normal  0.269109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0031  copper-translocating P-type ATPase  38.64 
 
 		 838 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0030  copper-translocating P-type ATPase  38.64 
 
 		 791 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000836932 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  36.36 
 
 		 805 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2534  hypothetical protein  46.15 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 816 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 785 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0904  YHS domain-containing protein  48.78 
 
 		 47 aa  41.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0790  YHS domain-containing protein  46.15 
 
 		 48 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0363  TRASH domain protein  32.14 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00964883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 		 826 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  42.5 
 
 		 831 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2247  RND family efflux transporter MFP subunit  38.98 
 
 		 737 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 773 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1417  YHS domain protein  46.15 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 		 815 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1315  YHS domain protein  46.15 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0440588  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1212  cation transport ATPase  36.67 
 
 		 902 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 		 815 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 		 815 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  38.3 
 
 		 846 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2261  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  41.18 
 
 		 389 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 973 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0324  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 842 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1328  hypothetical protein  39.58 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.662417  normal  0.163947 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  40 
 
 		 466 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 786 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0283  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 807 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2230  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 842 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2054  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 842 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860111  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3038  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 842 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1441  YHS domain-containing protein  43.9 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0620316  normal  0.0208977 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  38.64 
 
 		 797 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7880  heavy metal translocating P-type ATPase  36.73 
 
 		 788 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.862817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>