216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0753 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0753  permease  100 
 
 
389 aa  770    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  61.95 
 
 
392 aa  508  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  61.95 
 
 
389 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  63.09 
 
 
390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  61.88 
 
 
393 aa  457  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  64.77 
 
 
393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  64.14 
 
 
390 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  57.33 
 
 
389 aa  413  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  54.23 
 
 
433 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  51.63 
 
 
437 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  50 
 
 
461 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  47.4 
 
 
361 aa  332  5e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  46.97 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  47.13 
 
 
347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  45.5 
 
 
362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  46.57 
 
 
350 aa  300  4e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  46.47 
 
 
356 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  45.45 
 
 
343 aa  295  6e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1899  permease  50.41 
 
 
350 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  46.02 
 
 
343 aa  280  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  44.51 
 
 
357 aa  279  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  46.18 
 
 
367 aa  277  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  45.53 
 
 
359 aa  270  4e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  44.27 
 
 
386 aa  252  7e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0893  permease  45.74 
 
 
343 aa  249  8e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  46.46 
 
 
359 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  52.63 
 
 
489 aa  142  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  44.08 
 
 
452 aa  135  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0701  permease  54.42 
 
 
479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  25.7 
 
 
294 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1936  putative permease  53.09 
 
 
111 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0118434  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  23.34 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  22.22 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  22.56 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  22.65 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  20.17 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  22.78 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  21.67 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  22.84 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  21.82 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  22.84 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  23.44 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  23.4 
 
 
318 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  21.32 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  21.91 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  21.91 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  20.33 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  33.77 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  22.97 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  22.22 
 
 
365 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  23.39 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  22.32 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  24.63 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  30.5 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  24.67 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  24.18 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  22.3 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  22.56 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  22.56 
 
 
346 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  33.33 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  22.22 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  22.56 
 
 
346 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  20.27 
 
 
307 aa  67  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  21.08 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  19.67 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  24.93 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  22.51 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  22.22 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  22.95 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  21.79 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  27.34 
 
 
490 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  22.56 
 
 
346 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  22.36 
 
 
315 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  22.22 
 
 
346 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  22 
 
 
348 aa  63.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  22.22 
 
 
346 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  22.22 
 
 
346 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  22.22 
 
 
346 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  21.89 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  20.49 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  22.15 
 
 
337 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  32.43 
 
 
363 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  22.22 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  20.9 
 
 
315 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  22.44 
 
 
315 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  21.86 
 
 
315 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  18.98 
 
 
318 aa  59.7  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  27.64 
 
 
350 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  30.08 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  29.75 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  20.45 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  22.12 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  23.65 
 
 
330 aa  57.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  22.78 
 
 
298 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  22.61 
 
 
433 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  28.85 
 
 
349 aa  56.6  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  32.35 
 
 
323 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  22.57 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  22.04 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  22.26 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>