104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0701 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0701  permease  100 
 
 		 479 aa  926    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  63.67 
 
 		 489 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  59.96 
 
 		 452 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  35.39 
 
 		 433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  51.1 
 
 		 350 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  47.64 
 
 		 356 aa  162  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  51.3 
 
 		 347 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  44.75 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  44.39 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  49.7 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  44.92 
 
 		 361 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  49.7 
 
 		 389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  46.15 
 
 		 343 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  42.93 
 
 		 362 aa  151  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  46.35 
 
 		 357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  42.39 
 
 		 362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  50.36 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1899  permease  46.11 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  53.68 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  47.62 
 
 		 461 aa  146  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  43.98 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0753  permease  52.26 
 
 		 389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  52.9 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0893  permease  45.99 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  53.25 
 
 		 359 aa  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  47.88 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  43.45 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  40.66 
 
 		 359 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  38.42 
 
 		 367 aa  121  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  23.02 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1936  putative permease  50 
 
 		 111 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0118434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  20.34 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  20.15 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  20 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  20.69 
 
 		 500 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  31.67 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  33.02 
 
 		 356 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  21.41 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  21.54 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  22.25 
 
 		 474 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  19.8 
 
 		 503 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  20.45 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  27.44 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  27.4 
 
 		 363 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  33.71 
 
 		 337 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  26.97 
 
 		 293 aa  50.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  28.92 
 
 		 331 aa  50.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  30.3 
 
 		 350 aa  50.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  27.04 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  30.92 
 
 		 356 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  32.14 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  35.66 
 
 		 350 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  32.93 
 
 		 378 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  30.19 
 
 		 357 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.91 
 
 		 315 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  35.71 
 
 		 337 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  28.44 
 
 		 294 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  35.35 
 
 		 352 aa  47.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  35.48 
 
 		 318 aa  47.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  29.37 
 
 		 367 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  28.87 
 
 		 349 aa  47  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  29.93 
 
 		 451 aa  47  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  28.57 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  21.07 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1544  hypothetical protein  23.91 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000224631  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  24.55 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  29.27 
 
 		 315 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  31.71 
 
 		 352 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  35.37 
 
 		 358 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  26.43 
 
 		 332 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  26.72 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  29.29 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  29.75 
 
 		 333 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  28.72 
 
 		 338 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  27.66 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  38.46 
 
 		 333 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  28.17 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  36.92 
 
 		 359 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1637  permease  29.63 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3329  permease  32.99 
 
 		 350 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.598545 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  31.97 
 
 		 351 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  23.87 
 
 		 304 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  27.69 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  30.34 
 
 		 337 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1489  permease  29.91 
 
 		 352 aa  44.3  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283675  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  26.42 
 
 		 378 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  28.45 
 
 		 335 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  24.11 
 
 		 307 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  28.72 
 
 		 338 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  29.03 
 
 		 345 aa  43.9  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  28.57 
 
 		 345 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  28.57 
 
 		 345 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  29.03 
 
 		 346 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  29.03 
 
 		 346 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  33.73 
 
 		 402 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  29.03 
 
 		 346 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  29.03 
 
 		 346 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  28.8 
 
 		 423 aa  43.5  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1509  permease  29.66 
 
 		 352 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0642065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  29.03 
 
 		 346 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>