199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1899 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1899  permease  100 
 
 		 350 aa  671    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  49.86 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  49.86 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  51.1 
 
 		 390 aa  332  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  48.44 
 
 		 343 aa  322  8e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  49.3 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  48.6 
 
 		 347 aa  316  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0862  permease  48.13 
 
 		 356 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  49.62 
 
 		 437 aa  308  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0753  permease  50.14 
 
 		 389 aa  305  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  46.48 
 
 		 367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  48.85 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  48.28 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  51.25 
 
 		 389 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  49.02 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  49.86 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  50.56 
 
 		 390 aa  295  6e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  48.41 
 
 		 357 aa  295  7e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  46.76 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  44.95 
 
 		 461 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  43.97 
 
 		 361 aa  289  6e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0893  permease  50.57 
 
 		 343 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  45.55 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  46.7 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  50.43 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  44.24 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  45.74 
 
 		 489 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  42.63 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0701  permease  48.75 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  22.7 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  27.55 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  23.97 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  26.24 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  23.41 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  22.55 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  22.71 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  29.09 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  26.25 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  25.32 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  23.4 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  25 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  23.28 
 
 		 358 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  23.28 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  24.4 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  23.45 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  21.14 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  22.52 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  21.8 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  23 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  22.46 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  22.62 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  23.32 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  21.12 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  22.52 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  23.15 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  26.28 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  24.07 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  25.17 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  21.97 
 
 		 332 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  21.97 
 
 		 332 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  25.43 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  22.71 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  22 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  22.82 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  21.86 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  23.49 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  22.54 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  22.95 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  28.28 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  25.17 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  24.44 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  23.03 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  22.45 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  23.15 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  24.18 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  23.88 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  23.78 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  25.18 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  21.68 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  24.09 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  20.48 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  23.47 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  21.9 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  21.84 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  21.84 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  20.65 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  21.74 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  21.74 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  20.32 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  22.63 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  22.3 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  23.15 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  22.82 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  28.15 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  21.85 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  22.97 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  24.44 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  25.44 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  26.67 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  24.57 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>