More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2605 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2605  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  548  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2289  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2570  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2681  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525.1  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4244  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000170817  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3428  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000186024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0216  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000946054  normal  0.293728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4123  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000527418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0219  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0594  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354843  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0703  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0214  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000152565  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0670  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0253  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88055 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3789  LysR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46330  putative transcriptional regulator  35.77 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3500  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0910886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3932  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00420556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3734  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3805  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.829403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1118  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0619  LysR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3942  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3495  regulatory protein, LysR  27.14 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4272  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0195  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4139  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0195  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0310  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3696  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.643345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3449  regulatory protein, LysR  44.94 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05276  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3957  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 322 aa  72  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  32.93 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3796  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6977  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0307  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291876  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04895  transcriptional regulator  21.99 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2677  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.297592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1544  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2696  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0324  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  43.75 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0253  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4556  LysR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3947  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2971  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00357  transcriptional regulator  32 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0296  transcriptional regulator, LysR family protein  39.33 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  29.69 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0342  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3025  transcriptional regulator MexT  41.76 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  33.56 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8471  transcriptional regulator, LysR family  40.45 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  38.75 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1973  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2908  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000302  transcriptional regulator LysR family  39.58 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3824  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3949  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5290  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1917  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>