More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2289 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2289  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 311 aa  627  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3789  LysR family transcriptional regulator  57.7 
 
 		 306 aa  338  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0619  LysR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0594  LysR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354843  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3696  transcriptional regulator, LysR family  54.3 
 
 		 325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.643345  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2681  LysR family transcriptional regulator  57.19 
 
 		 306 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0703  LysR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497833  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0219  LysR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0670  LysR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 306 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2570  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3025  transcriptional regulator MexT  34.53 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  33.33 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 306 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1145  LysR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.415034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.01 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2060  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 301 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  35.22 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2746  transcriptional regulator MexT  33.66 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32410  transcriptional regulator MexT  33.33 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.76 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  32.12 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 306 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  29.07 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2908  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0902  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2460  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1036  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  29.3 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1383  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  27.44 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3517  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2183  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.0364497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1595  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2395  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0563871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1755  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4744  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33850  Transcriptional regulator MexT  32.87 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.57 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.99 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2547  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  37.32 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  29.14 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>