More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0670 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0670  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
306 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155019  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0703  LysR family transcriptional regulator  99.02 
 
 
306 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497833  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0219  LysR family transcriptional regulator  99.02 
 
 
306 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3789  LysR family transcriptional regulator  94.44 
 
 
306 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0594  LysR family transcriptional regulator  93.46 
 
 
306 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354843  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0619  LysR family transcriptional regulator  92.16 
 
 
306 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2681  LysR family transcriptional regulator  90.52 
 
 
306 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3696  transcriptional regulator, LysR family  61.26 
 
 
325 aa  359  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.643345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2570  LysR family transcriptional regulator  62.54 
 
 
304 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2289  transcriptional regulator, LysR family  57.86 
 
 
311 aa  316  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
320 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  38.33 
 
 
304 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
304 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32410  transcriptional regulator MexT  37.29 
 
 
304 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282605  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2746  transcriptional regulator MexT  36.96 
 
 
304 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 
310 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
304 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 
304 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.77 
 
 
304 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
306 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3025  transcriptional regulator MexT  35.11 
 
 
308 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  37.92 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2183  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
304 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.0364497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
300 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
300 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  34.53 
 
 
316 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
301 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
300 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2060  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2460  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
307 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2074  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
307 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 
305 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
307 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33850  Transcriptional regulator MexT  37.19 
 
 
314 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3517  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
308 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 
301 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1145  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
304 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.415034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
306 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
317 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3669  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
297 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1584  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.275662 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1383  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3265  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3102  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.7 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0451779  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.43 
 
 
300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1762  transcriptional regulator, LysR family  34.97 
 
 
321 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  32.44 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4016  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3902  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.981327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.01 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  35.47 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
315 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
345 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
307 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  28.66 
 
 
314 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
297 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
309 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  30.54 
 
 
309 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0307  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
308 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291876  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0902  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 
321 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4964  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
297 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
306 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
308 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
309 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
297 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3641  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
297 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
333 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0532671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>