More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07990 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA07990  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  100 
 
 
465 aa  935    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07310  conserved hypothetical protein  60 
 
 
465 aa  547  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34219  predicted protein  27.64 
 
 
364 aa  124  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.665929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  30.98 
 
 
1831 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.14 
 
 
1652 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  27 
 
 
696 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  30.31 
 
 
1454 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14176  predicted protein  24.52 
 
 
438 aa  104  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.16 
 
 
1510 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 
1481 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.73 
 
 
1789 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  29.22 
 
 
1523 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.66 
 
 
1364 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.61 
 
 
1553 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.07 
 
 
1163 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  27.43 
 
 
522 aa  97.4  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.95 
 
 
1236 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  29.67 
 
 
344 aa  96.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.75 
 
 
1217 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.43 
 
 
1193 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70252  protein involved in a late step of 60S ribosomal subunit assembly or modification contains multiple WD repeats interacts with Qsr1p  25.74 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.66 
 
 
676 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.07 
 
 
1004 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.67 
 
 
947 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.44 
 
 
1208 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.76 
 
 
1686 aa  93.6  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.21 
 
 
1188 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  29.08 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.39 
 
 
1363 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  27.96 
 
 
1599 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.28 
 
 
740 aa  90.9  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  26.74 
 
 
505 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27 
 
 
1807 aa  90.5  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.27 
 
 
682 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.41 
 
 
1901 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.83 
 
 
677 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  27.81 
 
 
1209 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.91 
 
 
1599 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04380  WD repeat protein, putative  25.4 
 
 
884 aa  87.4  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  27.68 
 
 
778 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.22 
 
 
464 aa  86.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.18 
 
 
1190 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.71 
 
 
1858 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.36 
 
 
630 aa  86.7  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  24.85 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.26 
 
 
1211 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.65 
 
 
1411 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07630  60S ribosome biogenesis protein Sqt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07390)  23.81 
 
 
525 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.404079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  26.81 
 
 
1661 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  26.27 
 
 
1714 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 
1474 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.35 
 
 
919 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.65 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.66 
 
 
742 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 
1311 aa  84  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  28.4 
 
 
1280 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.4 
 
 
924 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.92 
 
 
1760 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.56 
 
 
1221 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.67 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  25.93 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 
1196 aa  80.9  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.85 
 
 
1656 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.27 
 
 
596 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  23.78 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.16 
 
 
733 aa  79.7  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08183  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (Pwp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03090)  25.55 
 
 
851 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559435  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 
418 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.2 
 
 
1188 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.62 
 
 
1039 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.59 
 
 
1190 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  27.08 
 
 
774 aa  78.2  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.27 
 
 
1262 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  29.51 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  24.85 
 
 
597 aa  77.4  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  28.62 
 
 
1041 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  25.94 
 
 
608 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.62 
 
 
1868 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.18 
 
 
737 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  22.32 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  26.09 
 
 
589 aa  76.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  26.44 
 
 
1214 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.51 
 
 
564 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.26 
 
 
1247 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.55 
 
 
576 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  25.88 
 
 
872 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.43 
 
 
1443 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.83 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 
1878 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.83 
 
 
1213 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.27 
 
 
589 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.61 
 
 
1711 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.63 
 
 
1357 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.98 
 
 
642 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.55 
 
 
1617 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.15 
 
 
1161 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.15 
 
 
1161 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.71 
 
 
1623 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  34.3 
 
 
780 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  26.2 
 
 
1367 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>