More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2896 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2896  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3339  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.97 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2905  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2818  LysR family substrate binding transcriptional regulator  37.5 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.987922  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1558  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.78 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.525706  hitchhiker  0.00043239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0828  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2436  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399633  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 334 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3390  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318019  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2286  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0721  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  0.129513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  33.68 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5031  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  33.91 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1678  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3662  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6979  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3189  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2502  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.3 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0050  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.142799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0692  transcriptional regulator, LysR family  40.08 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3168  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2123  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4957  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 317 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5329  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0884153  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4317  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135379  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4908  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3410  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 317 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0692441  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001040  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  34.03 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2056  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  36.58 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 302 aa  158  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0475  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0530  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546421  normal  0.717973 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0979  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1327  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.893209 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3287  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2030  transcriptional regulator, LysR family  35.17 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2700  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469247  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 415 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4078  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>