More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0979 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0979  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
307 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039685  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3033  LysR family transcriptional regulator  63.29 
 
 
305 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0273235  normal  0.89504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  63.64 
 
 
298 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3565  transcriptional regulator, LysR family  62.85 
 
 
298 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35890  Regulatory protein, LysR family  61 
 
 
309 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1818  LysR family transcriptional regulator  63.51 
 
 
297 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17760  Transcriptional regulator, LysR family  62.07 
 
 
299 aa  362  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4908  LysR family transcriptional regulator  58.56 
 
 
299 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0880  LysR family transcriptional regulator  59.04 
 
 
294 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0339  LysR family transcriptional regulator  58.7 
 
 
294 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0638  LysR family transcriptional regulator  58.7 
 
 
294 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1042  LysR family transcriptional regulator  58.7 
 
 
294 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0086  LysR family transcriptional regulator  58.7 
 
 
294 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2473  LysR family transcriptional regulator  58.7 
 
 
294 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0883  LysR family transcriptional regulator  58.36 
 
 
294 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.427217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34690  LysR family transcriptional regulator  57.99 
 
 
297 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0262778  normal  0.106193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2944  putative transcriptional regulator  57.29 
 
 
297 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625117  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2614  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 
294 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2590  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 
294 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1980  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 
294 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0707  LysR family transcriptional regulator  56.34 
 
 
294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256747  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3137  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
323 aa  325  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1997  LysR family transcriptional regulator  53.63 
 
 
298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  52.9 
 
 
298 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4096  transcriptional regulator, LysR family  51.89 
 
 
308 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3304  LysR family transcriptional regulator  53.29 
 
 
313 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0884385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2638  LysR family transcriptional regulator  52.82 
 
 
294 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5921  LysR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
294 aa  311  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  51.54 
 
 
304 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0401  transcriptional regulator, LysR family  51.4 
 
 
299 aa  299  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0508531  normal  0.660201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1454  LysR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
296 aa  297  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.508797  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  52.41 
 
 
294 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3691  LysR family transcriptional regulator  51.38 
 
 
299 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 
294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  51.38 
 
 
294 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 
294 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6823  LysR family transcriptional regulator  51.74 
 
 
308 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  48.29 
 
 
297 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
296 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 
294 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 
296 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0459  transcriptional regulator, LysR family  49.48 
 
 
297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2016  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 
297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0915  transcriptional regulator, LysR family  48.28 
 
 
314 aa  269  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0231  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 
300 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1711  transcriptional regulator, LysR family  47.93 
 
 
300 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.530913  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 
305 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
334 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
334 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
334 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
334 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
302 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
304 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2286  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2792  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.41 
 
 
295 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
305 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  35.64 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
295 aa  195  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
301 aa  195  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  33.22 
 
 
289 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3529  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  33.11 
 
 
298 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382378 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 
300 aa  193  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
304 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
334 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
289 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
334 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
334 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
334 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
334 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
334 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
334 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
311 aa  192  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
288 aa  191  9e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
299 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3755  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
319 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
289 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
289 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
288 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
305 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  34.95 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 
300 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  35.44 
 
 
315 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
305 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
334 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
305 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3576  carbonate dehydratase  34.69 
 
 
309 aa  188  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
334 aa  188  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
289 aa  188  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
303 aa  188  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
335 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
301 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
303 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  35.56 
 
 
314 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
328 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 
334 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>