More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07440 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07440  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 387 aa  743    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3472  ROK family protein  36.99 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  36.43 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  37 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2815  ROK family protein  34.58 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231049  normal  0.37172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  32.09 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2213  ROK family protein  31.85 
 
 		 423 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.915289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31570  transcriptional regulator/sugar kinase  35.42 
 
 		 380 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.556832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  33.15 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  31.77 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.06 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  31.52 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  30.69 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.77 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  31.23 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  31.56 
 
 		 401 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  25.13 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  27.27 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.69 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.7 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1865  ROK family protein  25.59 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  30.03 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  26.63 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3774  ROK family protein  30.48 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.334489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  25.62 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.75 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  29.04 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1684  ROK family protein  25.59 
 
 		 391 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805279  normal  1 
 
 
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NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  27.25 
 
 		 435 aa  87  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
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NC_010816  BLD_1484  NagC family Transcriptional regulator  28.35 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.511985  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  26.28 
 
 		 393 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  30.77 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
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NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  30.17 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  35.11 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.16 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  24.27 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  24.27 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  24.27 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  24.27 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  24.27 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  23.87 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  27.16 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.43 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  23.98 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  23.98 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  23.98 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  23.98 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  23.98 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  23.98 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  24.92 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  23.98 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  23.98 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  23.98 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  27.19 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  26.1 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  24.79 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  27.01 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4501  ROK  27.35 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  21.65 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  26.05 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  28.34 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  23.08 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  28.04 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  26.51 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  26.51 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  26.51 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.98 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  26.11 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_23140  transcriptional regulator/sugar kinase  30 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.367865  normal  0.116398 
 
 
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NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  29.62 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  25.89 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  23.56 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.43 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  26.83 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  22.8 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  25.87 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  24.71 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.8 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  25.51 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  31.53 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  29.03 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  31.15 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  22.89 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  25.1 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0718  ROK family protein  31.08 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0541025 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  24.61 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  22.77 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  31.2 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  25.56 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  29.91 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  25.58 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  23.45 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  29.74 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  24.19 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  27.63 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
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NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  29.11 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  21.36 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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