More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2501 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2501  UspA domain protein  100 
 
 
156 aa  288  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2414  UspA domain protein  98.72 
 
 
156 aa  284  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1446  universal stress protein UspA  81.41 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  50.7 
 
 
164 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  46.21 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  50 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  50 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  44.76 
 
 
156 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  46.85 
 
 
162 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  47.89 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  45.33 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  44.08 
 
 
162 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  41.96 
 
 
151 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  43.42 
 
 
162 aa  90.5  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3093  UspA domain-containing protein  47.55 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  36.36 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.73 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  35.86 
 
 
153 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  35.86 
 
 
153 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  34.48 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.19 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  33.56 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.8 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.51 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.66 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.19 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  37.84 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  32.39 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  32.17 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  32.21 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.77 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  36.36 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.87 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.94 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.19 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  33.81 
 
 
305 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  37.41 
 
 
187 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  34.03 
 
 
285 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.99 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  39.04 
 
 
289 aa  61.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.14 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.37 
 
 
141 aa  60.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.35 
 
 
150 aa  60.5  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  39.31 
 
 
295 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  37.59 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.87 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  32.89 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  37.67 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  29.37 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  37.84 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.06 
 
 
138 aa  58.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  35.17 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  35.17 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.62 
 
 
140 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  27.92 
 
 
277 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  35.86 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  35.17 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  35.17 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  35.17 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  35.53 
 
 
167 aa  57.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.77 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  31.51 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  28.67 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  29.87 
 
 
166 aa  57.4  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  35.46 
 
 
134 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.08 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  33.54 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.19 
 
 
320 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  36.88 
 
 
134 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  38.46 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  33.1 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  28.48 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>