More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0476 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0476  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.36714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0481  transcriptional regulator, TetR family  98.21 
 
 		 223 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0448  TetR family transcriptional regulator  91.58 
 
 		 223 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  57.67 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  35.14 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  29.25 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 207 aa  62  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  31.36 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  28.57 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  25.77 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.1 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  28.9 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  25.77 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  30.91 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  25.77 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  25.77 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  26.84 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  31.37 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3484  nucleoid occlusion protein  25.76 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000984177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  27.11 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  27.11 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  27.11 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  27.11 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  31.68 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  25.75 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  25.12 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  29.46 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  31.31 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  26.84 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1324  nucleoid occlusion protein  32.53 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0181  nucleoid occlusion protein  29.09 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  26.35 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  22.49 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 429 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 192 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0323  nucleoid occlusion protein  25.29 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000549659  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0193  nucleoid occlusion protein  30.72 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0183  nucleoid occlusion protein  30.72 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24476  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  30.43 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>