More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0894 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0894  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  588  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0863  hypothetical protein  96.81 
 
 		 282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  30.94 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  31.5 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  31.05 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  33.59 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  31.9 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  31.9 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  30.63 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  31.39 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  31.27 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  30.66 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  30.4 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  30.4 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  28.88 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 267 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  30.74 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  28.83 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  28.52 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  28.1 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.51 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  35.44 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  38.01 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  32.33 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  27.74 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.96 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  32.45 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  28.85 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  30.54 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  32 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 258 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  32.41 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  35.53 
 
 		 265 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.84 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  30.93 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.54 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 248 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35072  normal  0.362703 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03130  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  29.8 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  29.54 
 
 		 273 aa  99.4  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.87 
 
 		 245 aa  99  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.685444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.9 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.9 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.319176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.9 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.02 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  31.77 
 
 		 253 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  26.32 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.06 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 245 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.38 
 
 		 259 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  26.74 
 
 		 298 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 253 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.47 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  27.04 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  29.8 
 
 		 602 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 		 255 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.73 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.4 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  30.73 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.77 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 245 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  28.92 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>