More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3096 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
266 aa  540  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25739  predicted protein  45.69 
 
 
285 aa  216  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.257368  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
247 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  39.77 
 
 
257 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.08 
 
 
249 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
256 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.15 
 
 
245 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
270 aa  158  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.93 
 
 
246 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.02 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
255 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
246 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.63 
 
 
246 aa  155  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
263 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.50771  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.15 
 
 
245 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
259 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
252 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2858  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.92 
 
 
246 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
250 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649424  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
260 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
253 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  35.98 
 
 
259 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
258 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.23 
 
 
245 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.27 
 
 
248 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  33.72 
 
 
259 aa  148  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
252 aa  148  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
255 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.46 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  31.58 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
253 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
245 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
253 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.5 
 
 
261 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
258 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
256 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.25 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2283  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  38.4 
 
 
251 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.890359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
250 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
246 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
255 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
246 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 
253 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.65 
 
 
246 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
245 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.84 
 
 
247 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.18 
 
 
261 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.18 
 
 
261 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 
256 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
253 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 
256 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 
256 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
256 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
244 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
249 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
254 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
272 aa  141  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.08 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  36.43 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 
253 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.72 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00276657  normal  0.102342 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.96 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  33.7 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  38.31 
 
 
251 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
245 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.09 
 
 
248 aa  138  7.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.09 
 
 
246 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  34.44 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
248 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
256 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.25 
 
 
246 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
252 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
265 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3141  Dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)-like protein  37.08 
 
 
339 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.754311  normal  0.0847511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.92 
 
 
246 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
255 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  33.96 
 
 
291 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
245 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  38.85 
 
 
261 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
255 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
255 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
253 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
248 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.883232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 
252 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
250 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0741311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  34.8 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>