More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4654 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  64.56 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 244 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  64.29 
 
 		 237 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  60.26 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  51.43 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  44.23 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  46.23 
 
 		 227 aa  171  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  50.46 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  45.1 
 
 		 230 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  45.1 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  46.92 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  45.1 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  47 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  47 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  41.46 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  42.44 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  42.51 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  44.08 
 
 		 218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  47 
 
 		 223 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 221 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  40 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  42.56 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  37.95 
 
 		 218 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  36.61 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  37.57 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 216 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 230 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  99.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  39.57 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.33 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 216 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  34.31 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 222 aa  95.1  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>