More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1892 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
147 aa  286  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  41.5 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  43.54 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  43.15 
 
 
148 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  40.82 
 
 
149 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  40.14 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  40.14 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.54 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  42.86 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  40.82 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  40.14 
 
 
154 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  35.57 
 
 
154 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  35.86 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  32.64 
 
 
563 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  35.21 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.17 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  34.38 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0093  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.93 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.132878  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0086  cyclic nucleotide-binding protein  36.55 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.929528  normal  0.0740226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.59 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.06 
 
 
219 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0279  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.79 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0285  cyclic nucleotide-binding protein  34.97 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4104  cyclic nucleotide-binding protein  33.56 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.374225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  31.03 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  34.09 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  36.07 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4030  cyclic nucleotide-binding protein  27.14 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  35.51 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  30.5 
 
 
413 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  32.58 
 
 
857 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  27.61 
 
 
570 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  34.78 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  29.84 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  29.84 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  32.31 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  32.56 
 
 
1043 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1854  cyclic nucleotide-binding protein  31.97 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1575  cyclic nucleotide-binding  32.65 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
226 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.82 
 
 
503 aa  63.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.21 
 
 
425 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  32.85 
 
 
583 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 
225 aa  62.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  31.21 
 
 
425 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  28.69 
 
 
322 aa  62.8  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 
226 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
265 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  33.98 
 
 
275 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  32.09 
 
 
482 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  31.54 
 
 
224 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  29.03 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  31.5 
 
 
453 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  32.8 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  34.26 
 
 
265 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  34.26 
 
 
265 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.86 
 
 
224 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
161 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  31.51 
 
 
1017 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 
419 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  29.23 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  28.15 
 
 
357 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
225 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
876 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  31.11 
 
 
381 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 
495 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  29.84 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.36 
 
 
220 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  30.53 
 
 
243 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.55 
 
 
209 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.71 
 
 
225 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  43.53 
 
 
512 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.15 
 
 
242 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  31.54 
 
 
860 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  29.84 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.81 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.97 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
226 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.51 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  27.68 
 
 
747 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  29.23 
 
 
226 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  30.37 
 
 
286 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
811 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  32.19 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1664  cyclic nucleotide-binding protein  29.8 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.87 
 
 
231 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.27 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 
832 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  32.76 
 
 
482 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
215 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  26.9 
 
 
785 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  40.91 
 
 
1065 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.11 
 
 
220 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
215 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.37 
 
 
225 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  30.07 
 
 
454 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  25.19 
 
 
230 aa  54.7  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 
308 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>