More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4607 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  59.68 
 
 		 250 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  59.04 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  56.56 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  56.85 
 
 		 251 aa  274  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  62.7 
 
 		 255 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  54.22 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  54.44 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  56.5 
 
 		 249 aa  254  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.59 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  55.92 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  50.83 
 
 		 246 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  52.02 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  51.03 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  53.28 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  48.57 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  53.66 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  50.61 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  49.59 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  47.97 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  49.18 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  52.03 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 250 aa  224  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  47.74 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  50.2 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  48.56 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  47.33 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  48.37 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  47.81 
 
 		 251 aa  221  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  47.98 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  46.89 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  47.52 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  49.17 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  47.56 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  45.27 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  50.2 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  45.16 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  48.59 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  44.03 
 
 		 859 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  46.69 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  46.28 
 
 		 840 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  51.64 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  44.03 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  44.86 
 
 		 249 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  46.75 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  44.03 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  42.8 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  45.16 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  44.76 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  43.21 
 
 		 249 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  43.6 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  42.17 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  43.95 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  43.9 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  42.46 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  44.31 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  46.53 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  43.15 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  45.08 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  43.09 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3752  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.29 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.29 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3763  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.29 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3830  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.29 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.27 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.64 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  43.32 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  42.86 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  45.64 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  42.74 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  47.74 
 
 		 256 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3932  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  43.27 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  42.17 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  45.27 
 
 		 282 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  43.9 
 
 		 252 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  46.09 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.68 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  45.04 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  42.17 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.68 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  44.86 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1791  ABC transporter related  44.94 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  41.63 
 
 		 259 aa  198  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  48.97 
 
 		 233 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.56 
 
 		 233 aa  198  9e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0260  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3934  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  44.08 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4772  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03257  hypothetical protein  41.11 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0261  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3737  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>