More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0330 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  100 
 
 		 292 aa  587  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  78.63 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  76.1 
 
 		 260 aa  391  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  75.6 
 
 		 255 aa  387  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  67.47 
 
 		 254 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  62.8 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  64.84 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  64.84 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  64.45 
 
 		 254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  65.87 
 
 		 254 aa  324  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  45.7 
 
 		 256 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  45.7 
 
 		 256 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 257 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 257 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  44 
 
 		 256 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  42.02 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.72 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  45.06 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  42.8 
 
 		 536 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  43.72 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  43.82 
 
 		 267 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 251 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  44.62 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  39.76 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  45.78 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  43.32 
 
 		 254 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  43.95 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  43.92 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  43.55 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  41.37 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  41.96 
 
 		 252 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  40.8 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  43.78 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  41.56 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  41.56 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  41.98 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  41.57 
 
 		 859 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  39.53 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  39.04 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  43.43 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  42.4 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  39.45 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  39.11 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  41.27 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  41.2 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  40.65 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  39.44 
 
 		 257 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  42.91 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  40.8 
 
 		 842 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  40 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  38.33 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  38.33 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  38.35 
 
 		 275 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  38.35 
 
 		 275 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  38.35 
 
 		 275 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  39.04 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  38.65 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  38.34 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  39.04 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  41.53 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  40.15 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  38.4 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  39.68 
 
 		 250 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 		 250 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  40.71 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  38.65 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  40.16 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  38.65 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  39.68 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  40.71 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  37.75 
 
 		 250 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 256 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  38.4 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  37.35 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  42.04 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  38.4 
 
 		 261 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  40.73 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  39.92 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  37.92 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  44.18 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  40.48 
 
 		 253 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  38.8 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  40.48 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  38.4 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  39.84 
 
 		 253 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  35.69 
 
 		 283 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0483  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  39.68 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>