More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0499 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  71.48 
 
 		 271 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  68.89 
 
 		 294 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  58.09 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  56.99 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  54.78 
 
 		 275 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  55.51 
 
 		 280 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  57.62 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  53.7 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  52.96 
 
 		 275 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  54.35 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  53.33 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  54.55 
 
 		 272 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  53.7 
 
 		 267 aa  289  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  52.21 
 
 		 275 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  53.7 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  54.04 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  52.73 
 
 		 279 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  55.35 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  52.59 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  51.85 
 
 		 279 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  52.57 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  52.57 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  54.44 
 
 		 280 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  51.11 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  51.84 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  50.37 
 
 		 283 aa  275  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  52.17 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  52.21 
 
 		 280 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  50.37 
 
 		 270 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  51.48 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  52.59 
 
 		 280 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  52.21 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  52.21 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  50.74 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  47.97 
 
 		 294 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  44.44 
 
 		 267 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 290 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  43.12 
 
 		 273 aa  208  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  39.84 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  36.84 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  36.3 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  35.32 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  39.53 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  36.43 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  36.26 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  33.33 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  35.06 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  38.05 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  39.57 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  33.58 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  35.63 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  33.69 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  37.74 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  35.47 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  34.11 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  35.34 
 
 		 286 aa  138  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  34.21 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  33.07 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  35.61 
 
 		 284 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  33.46 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  34.88 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  41.32 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  34.93 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  35.66 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  45.51 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  32.59 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  30.56 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  35.84 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  38.27 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  37.11 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  38.27 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  29.41 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  36.09 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  29.48 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  29.6 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  29.6 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  29.6 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  29.17 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  36.48 
 
 		 264 aa  89  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  33.77 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  35.8 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  33.14 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  32.74 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  39.66 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  30.99 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  29.59 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  32.39 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  30.85 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  36 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3345  transglutaminase domain protein  25.77 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.450591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  28.98 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  28.65 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  29.29 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.77 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  34.23 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  32.89 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  36.03 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>