More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01762 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  100 
 
 		 714 aa  1467    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 849 aa  285  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 697 aa  265  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 738 aa  264  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 717 aa  252  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 716 aa  250  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 701 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 701 aa  240  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 710 aa  239  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 700 aa  238  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 718 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 723 aa  237  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 723 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  27.56 
 
 		 723 aa  231  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 725 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 725 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 725 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 723 aa  226  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 725 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 723 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 704 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 721 aa  219  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  28.63 
 
 		 713 aa  217  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 839 aa  217  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  28.61 
 
 		 813 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  28.69 
 
 		 816 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  27.55 
 
 		 713 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  27.21 
 
 		 755 aa  215  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  29.23 
 
 		 771 aa  211  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 726 aa  209  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  26.98 
 
 		 733 aa  209  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 726 aa  208  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 726 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  25.98 
 
 		 709 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 746 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 		 732 aa  201  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  26.37 
 
 		 732 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  27.11 
 
 		 812 aa  194  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 758 aa  191  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 751 aa  190  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 843 aa  187  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  25.45 
 
 		 704 aa  187  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 783 aa  187  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 817 aa  187  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  26.42 
 
 		 721 aa  186  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 745 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 745 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 742 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 745 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  26.12 
 
 		 724 aa  180  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 764 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 808 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 817 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 739 aa  170  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 808 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 809 aa  164  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 698 aa  164  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 728 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 716 aa  148  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  32.41 
 
 		 332 aa  127  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  33.78 
 
 		 723 aa  124  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 753 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 762 aa  88.6  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 700 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 688 aa  86.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 678 aa  85.5  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 700 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 700 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 700 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 764 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 736 aa  84.7  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 700 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 688 aa  84.3  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 686 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 700 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.24 
 
 		 700 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1099  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 700 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  24.14 
 
 		 764 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.24 
 
 		 700 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  30 
 
 		 618 aa  82.4  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 737 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  33.33 
 
 		 631 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  24.14 
 
 		 764 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 715 aa  80.9  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  40.12 
 
 		 680 aa  80.5  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  29.78 
 
 		 628 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 		 704 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  40.14 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  32.28 
 
 		 647 aa  78.2  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  36.09 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  38.75 
 
 		 656 aa  77.8  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1552  TonB-dependent receptor HmuR  35.29 
 
 		 646 aa  76.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  40.25 
 
 		 650 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  40.25 
 
 		 650 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.31 
 
 		 630 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  35 
 
 		 623 aa  77  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.57 
 
 		 615 aa  77  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.31 
 
 		 630 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  40.25 
 
 		 650 aa  77.4  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>