215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000210 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  100 
 
 
1054 aa  2164    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  50.9 
 
 
772 aa  744    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  52.04 
 
 
904 aa  807    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  47.57 
 
 
997 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  55.02 
 
 
855 aa  810    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  53.54 
 
 
1129 aa  991    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  52.2 
 
 
1127 aa  988    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  54.97 
 
 
1146 aa  1020    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  89.66 
 
 
1053 aa  1950    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  52.71 
 
 
1127 aa  999    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  80.18 
 
 
1051 aa  1630    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  52.3 
 
 
1127 aa  990    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  47.02 
 
 
760 aa  673    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  52.5 
 
 
1127 aa  995    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  29.37 
 
 
703 aa  230  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  37.35 
 
 
484 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  30.11 
 
 
372 aa  192  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  25.59 
 
 
634 aa  185  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 
674 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  29.22 
 
 
674 aa  164  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  29.03 
 
 
674 aa  163  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  29.03 
 
 
674 aa  162  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  28.83 
 
 
674 aa  162  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  28.83 
 
 
674 aa  162  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  28.83 
 
 
674 aa  162  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  28.27 
 
 
674 aa  162  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  28.83 
 
 
674 aa  162  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  28.83 
 
 
674 aa  162  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  39.06 
 
 
846 aa  160  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  27.86 
 
 
652 aa  160  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 
674 aa  160  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  27.93 
 
 
482 aa  159  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  37.68 
 
 
846 aa  154  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  45.77 
 
 
1152 aa  147  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  36.72 
 
 
848 aa  145  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.27 
 
 
382 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  31.16 
 
 
846 aa  140  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  27.39 
 
 
431 aa  139  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  29.1 
 
 
639 aa  138  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  26.17 
 
 
377 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  42.33 
 
 
1123 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  27.48 
 
 
521 aa  128  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  25.45 
 
 
499 aa  127  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  25.7 
 
 
1271 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  25 
 
 
1080 aa  117  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  25.86 
 
 
505 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  26.02 
 
 
414 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  27.03 
 
 
868 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  26.8 
 
 
848 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 
868 aa  116  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  26.15 
 
 
867 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  25.65 
 
 
848 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  26.41 
 
 
401 aa  114  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 
868 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  42.31 
 
 
1285 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  27.07 
 
 
559 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  25.43 
 
 
855 aa  112  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  25.45 
 
 
972 aa  111  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  27.26 
 
 
868 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  26.85 
 
 
398 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  26.49 
 
 
563 aa  108  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  37.45 
 
 
1047 aa  107  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  26.85 
 
 
868 aa  107  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  23.55 
 
 
657 aa  106  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  27.27 
 
 
763 aa  105  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  26.33 
 
 
762 aa  105  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  28.45 
 
 
869 aa  104  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  28.87 
 
 
373 aa  104  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  27.48 
 
 
463 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  26.76 
 
 
430 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 
1578 aa  102  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  43.09 
 
 
1219 aa  102  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  26.72 
 
 
455 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  33.89 
 
 
1362 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  25.43 
 
 
652 aa  99  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  24.68 
 
 
854 aa  98.6  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  28.63 
 
 
1246 aa  97.8  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 
465 aa  97.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  23.27 
 
 
563 aa  97.4  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  27.1 
 
 
425 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  27.93 
 
 
396 aa  95.5  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  28.06 
 
 
388 aa  92  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.39 
 
 
816 aa  91.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  27.78 
 
 
586 aa  90.9  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 
863 aa  89.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  29.92 
 
 
675 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
426 aa  90.1  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  32.81 
 
 
1406 aa  89.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 
472 aa  89.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  27.82 
 
 
1443 aa  89.4  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.33 
 
 
767 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  24.6 
 
 
407 aa  86.3  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  30.3 
 
 
1059 aa  85.5  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  39.23 
 
 
1096 aa  85.5  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  26.65 
 
 
1782 aa  84.7  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  24.84 
 
 
792 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  23.91 
 
 
355 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  36.17 
 
 
482 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.58 
 
 
979 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  28.66 
 
 
662 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>