95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3773 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3773  periplasmic binding protein  100 
 
 		 337 aa  666    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  29.9 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0561  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  28.62 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0592  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0403  periplasmic binding protein  26.41 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3792  periplasmic binding protein  30.16 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0976138  normal  0.756934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5103  periplasmic binding protein  27.74 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26390  hypothetical protein  27.8 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.660026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1288  hypothetical protein  24.32 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.120797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1331  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2241  hypothetical protein  27.8 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1349  periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0868  periplasmic binding protein  28.04 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1414  membrane transport solute-binding protein  27.45 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5562  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.77 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4491  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  25.76 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3191  membrane transport solute-binding protein  26.14 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3152  putative iron chelate uptake ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.28 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5019  ABC transporter substrate binding protein (iron)  23.55 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3208  periplasmic binding protein  26.28 
 
 		 660 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1608  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0163277  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3576  periplasmic binding protein  23.29 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.113907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3882  periplasmic binding protein  27.95 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0174  periplasmic binding protein  25.17 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3324  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.99567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0186  periplasmic binding protein  24.42 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2582  periplasmic binding protein  27.01 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2437  periplasmic binding protein  28.88 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0367724  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17630  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.13 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16394  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2980  periplasmic binding protein  24.12 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.628354  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4829  periplasmic binding protein  26.97 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0967  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2732  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1651  periplasmic binding protein  26.19 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.342986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2656  periplasmic binding protein  23.98 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.19637  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0441  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4278  periplasmic binding protein  25.43 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3256  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  25.41 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273216  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0149  periplasmic binding protein  23.36 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1428  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0547  periplasmic binding protein  22.44 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2771  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.127784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2323  periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3392  ABC Fe3+-siderophores transporter, periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3094  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0239264  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2934  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371372  normal  0.385675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3724  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0756  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  24.03 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.648016  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3038  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0705  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  24.03 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.132797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3277  periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1929  periplasmic binding protein  23.78 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.047072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2058  periplasmic binding protein  24.18 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4224  periplasmic binding protein  23.58 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4782  periplasmic binding protein  30.11 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2706  periplasmic binding protein  24.75 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23960  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.32 
 
 		 394 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.854026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2418  periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  27.09 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  28.17 
 
 		 299 aa  53.1  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  21.97 
 
 		 335 aa  52.8  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2275  periplasmic binding protein  24.01 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5102  periplasmic binding protein  25.52 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0139456  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2601  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0806884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  21.48 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1136  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  20.63 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3912  periplasmic binding protein  30.5 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000229928  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  21.82 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4081  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.364938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21280  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.23 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2713  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound binding protein  23.77 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.103757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0879  membrane transport solute-binding protein  23.77 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  21.72 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1362  periplasmic binding protein  23.28 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  25.52 
 
 		 267 aa  46.2  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3916  periplasmic binding protein  24.59 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3916  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3804  periplasmic-binding protein  27.23 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.118967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1600  periplasmic binding protein  24.1 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.05 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0124  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000158909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4239  periplasmic binding protein  23.13 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  19.34 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4861  periplasmic-binding protein  26.29 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  24.1 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3205  periplasmic binding protein  21.19 
 
 		 332 aa  42.7  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.954932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3093  periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 297 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>