80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0543 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0543  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 325 aa  639    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.979226  hitchhiker  0.000989319 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1431  MscS mechanosensitive ion channel  75.94 
 
 		 331 aa  518  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.23778  normal  0.0751617 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0843  MscS mechanosensitive ion channel  59.75 
 
 		 324 aa  401  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  58.25 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1616  MscS Mechanosensitive ion channel  43.58 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  37.99 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 308 aa  93.6  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1868  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.016282  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3252  MscS Mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1186  MscS mechanosensitive ion channel  31.69 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.757811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5057  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.58 
 
 		 238 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.755901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 279 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 292 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.32 
 
 		 291 aa  49.7  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  29.41 
 
 		 794 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 479 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  23.67 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  23.72 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1897  small-conductance mechanosensitive channel-like  26.92 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  24.82 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  26.51 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  23.64 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  29.61 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  23.67 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4989  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0847315  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3171  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.10941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4309  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000550538  decreased coverage  0.0000000451244 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 627 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 288 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  24.26 
 
 		 407 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 475 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  22.75 
 
 		 289 aa  46.2  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 389 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  31.09 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  32.98 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1786  MscS family inner membrane protein YnaI  30.34 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0416525  normal  0.388102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  30.34 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  30.34 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  30.14 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  30.14 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.06 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  30.14 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  30.14 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.14 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  30.14 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  23.9 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  30.14 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  28.79 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 480 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1670  MscS family inner membrane protein YnaI  30.34 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.107683 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1788  MscS family inner membrane protein YnaI  30.34 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  27.69 
 
 		 1115 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6057  MscS Mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 		 779 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  21.3 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  24.47 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 508 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 475 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  29.93 
 
 		 531 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 475 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5823  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.440829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  26.71 
 
 		 271 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  34.44 
 
 		 561 aa  42.7  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 533 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  22.73 
 
 		 351 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>