More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1711 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1711  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 354 aa  718    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0787  putative PAS/PAC sensor protein  66.19 
 
 		 356 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0219  putative PAS/PAC sensor protein  45.3 
 
 		 352 aa  300  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2152  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.42 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1587  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.8 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.275085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2068  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.13 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2700  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.54 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0589  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.34 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1163  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.88 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0867  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.97 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.711393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0936  GGDEF domain-containing protein  38.1 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1960  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.06 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3480  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.72 
 
 		 301 aa  89.4  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00742863  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2569  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.84 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.809417  hitchhiker  0.000987173 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3328  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.58 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  24.74 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.4 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0918  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.84 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0046e-32 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0999  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.766542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2969  sensory box/GGDEF family protein  33.33 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.08 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  31.25 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  31.25 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  31.25 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  31.67 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  31.25 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  31.25 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  31.67 
 
 		 380 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.32 
 
 		 496 aa  65.9  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  26.34 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  31.25 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  26.48 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  29.19 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.53 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  25.51 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.7 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  24.55 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  23.79 
 
 		 533 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  21.62 
 
 		 775 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.24 
 
 		 885 aa  62.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.122951 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  31.58 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  25.42 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2302  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  30.43 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.957796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  20.78 
 
 		 602 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  23.14 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  27.96 
 
 		 693 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  24.69 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  23.85 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.69 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  24.05 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  22.53 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  22.53 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.9 
 
 		 526 aa  59.7  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  26.27 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1125  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  29.73 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.25 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  25.68 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  27.47 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1503  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.85 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.3 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.88 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1684  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.57 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.16 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  23.08 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  23.33 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  27.43 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.67 
 
 		 1355 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.9 
 
 		 806 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0337434  hitchhiker  0.00302183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1976  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  29.57 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  28.93 
 
 		 1046 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.925436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0572  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  27.42 
 
 		 459 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  24.56 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.88 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  24.52 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  23.89 
 
 		 644 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.67 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1580  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.82 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  23.34 
 
 		 581 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  22.62 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  20.54 
 
 		 684 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1702  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.3 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.4 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.4 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  20.44 
 
 		 415 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  23.86 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  20.43 
 
 		 642 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.55 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  21.58 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  23.83 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  30.37 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1246  putative PAS/PAC sensor protein  27.43 
 
 		 508 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  22.59 
 
 		 472 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2133  putative PAS/PAC sensor protein  28.1 
 
 		 141 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  25.25 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 705 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.8 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  25.51 
 
 		 840 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>