296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0787 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0787  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 356 aa  719    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1711  putative PAS/PAC sensor protein  66.19 
 
 		 354 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0219  putative PAS/PAC sensor protein  41.14 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0936  GGDEF domain-containing protein  35.56 
 
 		 301 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2068  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.55 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1960  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.57 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1587  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.65 
 
 		 297 aa  100  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.275085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1163  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.2 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2152  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.86 
 
 		 300 aa  95.9  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2700  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.02 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0867  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.8 
 
 		 312 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.711393  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2569  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.84 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.809417  hitchhiker  0.000987173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0589  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.62 
 
 		 305 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3328  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.28 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0918  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.37 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0046e-32 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3480  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.05 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00742863  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  30.04 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0999  response regulator receiver protein  33.69 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.766542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.02 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2969  sensory box/GGDEF family protein  30.83 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.64 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1556  serine phosphatase  26.19 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  26.24 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  28.63 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  28.63 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  28.63 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  28.63 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2302  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.07 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.957796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  28.63 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  26.87 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  27.32 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  28.23 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.12 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.57 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  26.1 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  30.46 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  22.66 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  25 
 
 		 644 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.56 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.19 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  24.9 
 
 		 472 aa  62.8  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.6 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.82 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.31 
 
 		 678 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0392  serine phosphatase  28.91 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0288764  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  28.04 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  36.04 
 
 		 885 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.122951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.33 
 
 		 806 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0337434  hitchhiker  0.00302183 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  24.38 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  27.65 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0010  putative PAS/PAC sensor protein  30.15 
 
 		 750 aa  60.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0248614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  26.91 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  26.47 
 
 		 1046 aa  60.1  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.925436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  26.91 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.3 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.25 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.61 
 
 		 566 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  24.1 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.35 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0171  putative PAS/PAC sensor protein  23.2 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  27.74 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  26.95 
 
 		 705 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  24.63 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1539  protein serine/threonine phosphatase  24.51 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  25.1 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.5 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1976  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.61 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.59 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  23.49 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3196  Fis family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  24.87 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  27.62 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  26.34 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03428  PAS signal transduction protein  27.15 
 
 		 962 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1684  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  27.48 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.62 
 
 		 581 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.49 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  23.48 
 
 		 455 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2053  Fis family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 664 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0572  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.26 
 
 		 459 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.22 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  22.87 
 
 		 516 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  27.13 
 
 		 706 aa  56.6  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.75 
 
 		 1093 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.653084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  24.3 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5480  protein serine/threonine phosphatase  26 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00189535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  25.18 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.95 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.95 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.83 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  21.37 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  25.86 
 
 		 509 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1580  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  24.47 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  24.9 
 
 		 708 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1702  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.47 
 
 		 460 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  20.78 
 
 		 775 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  28.04 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 556 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>