More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0811 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0926  TPR repeat-containing protein  59.12 
 
 
148 aa  169  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1345  TPR repeat-containing protein  42.27 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00066539  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1341  TPR repeat-containing protein  41.24 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.39 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  47.76 
 
 
733 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  44.59 
 
 
587 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 
909 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  32.14 
 
 
561 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.87 
 
 
810 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  32.14 
 
 
561 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  41.03 
 
 
732 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
1406 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  29.03 
 
 
661 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  30.19 
 
 
299 aa  60.5  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
718 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.51 
 
 
320 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 
681 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
265 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  33.65 
 
 
1154 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.2 
 
 
878 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  42.35 
 
 
637 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  40.79 
 
 
1486 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 
273 aa  58.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
1737 aa  58.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
219 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  44.78 
 
 
545 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  36.13 
 
 
865 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
3035 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  43.53 
 
 
430 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
323 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
3560 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  37.62 
 
 
603 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  32.38 
 
 
594 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  30.25 
 
 
219 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  30.25 
 
 
219 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
219 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
828 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  49.18 
 
 
764 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  30.25 
 
 
219 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  30.25 
 
 
219 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  30.25 
 
 
219 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
219 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  30.25 
 
 
219 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  30.25 
 
 
219 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  32.69 
 
 
566 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
209 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 
237 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
280 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 
700 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  41.18 
 
 
725 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.09 
 
 
714 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
833 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.73 
 
 
1677 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  46.97 
 
 
622 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  43.28 
 
 
208 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  34.41 
 
 
837 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  28.87 
 
 
1014 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.75 
 
 
632 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  36.47 
 
 
395 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 
732 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 
232 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.18 
 
 
263 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 
828 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 
3145 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 
833 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  47.14 
 
 
314 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  38.2 
 
 
1694 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
714 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 
750 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  48.44 
 
 
206 aa  53.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  38.46 
 
 
887 aa  53.9  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
274 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 
828 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
263 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
968 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
219 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  35.58 
 
 
266 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  38.82 
 
 
392 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  36.9 
 
 
816 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  36.47 
 
 
875 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
750 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
4489 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
3301 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
697 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
2262 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 
448 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 
465 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
688 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
216 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
605 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 
247 aa  52  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
1827 aa  52  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 
421 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
265 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
190 aa  52  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 
265 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
452 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
750 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>