230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1341 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1341  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 140 aa  280  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1345  TPR repeat-containing protein  97.14 
 
 		 140 aa  275  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00066539  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0926  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  41.24 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 214 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.81 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.67 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  29.31 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  29.31 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  29.31 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  29.31 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  29.31 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  29.31 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  29.31 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  34.62 
 
 		 1154 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 211 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 208 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1051  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 538 aa  52.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0829  tetratricopeptide TPR_2  34.04 
 
 		 394 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  34.57 
 
 		 1013 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  32.11 
 
 		 594 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.06 
 
 		 208 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 605 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1061  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 538 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000210064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 288 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 935 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 878 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  32.93 
 
 		 992 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 1406 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  27.87 
 
 		 299 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  35.23 
 
 		 837 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 2240 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.77 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 589 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.85 
 
 		 222 aa  48.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.93 
 
 		 476 aa  48.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1676 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  35.71 
 
 		 266 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3274  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 416 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.63 
 
 		 417 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  32.47 
 
 		 198 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 363 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 1121 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 534 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 		 927 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1317  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000469709  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 3560 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  34.95 
 
 		 400 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  38.27 
 
 		 936 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  32.94 
 
 		 503 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.29 
 
 		 875 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  32.26 
 
 		 643 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 265 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1601  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 		 355 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.799203  unclonable  3.52104e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 265 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  35.87 
 
 		 379 aa  46.6  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2921  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30 
 
 		 810 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3549  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 421 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1999  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 417 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 402 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  30.12 
 
 		 631 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 565 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 654 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 388 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 465 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 602 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2098  tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein  32 
 
 		 653 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 968 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 209 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 388 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 311 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 311 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 760 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  34.18 
 
 		 288 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 4079 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 733 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4942  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00284868  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 632 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 356 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 955 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 287 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 235 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 566 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>