253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1387 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  100 
 
 		 468 aa  902    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  44.74 
 
 		 445 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  47.29 
 
 		 436 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  49.31 
 
 		 468 aa  317  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  47.61 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 472 aa  303  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 461 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  35.5 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 471 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 464 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 506 aa  256  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 480 aa  250  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  36.49 
 
 		 453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  40.18 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  41.73 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 407 aa  202  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  42.37 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  41.48 
 
 		 439 aa  200  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  38.6 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  35.38 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  40.05 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  38.77 
 
 		 453 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.4 
 
 		 472 aa  156  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  39.62 
 
 		 445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 457 aa  153  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 471 aa  146  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  36.07 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.81 
 
 		 476 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  27.04 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.38 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  34.4 
 
 		 409 aa  126  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.6 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.6 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.68 
 
 		 469 aa  120  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  25.62 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  36.13 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0255  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.19 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  25.15 
 
 		 481 aa  106  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  25.05 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  25.15 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  25.05 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  25.05 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.36 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  25.76 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  27.31 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  36.34 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.05 
 
 		 469 aa  103  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  33.25 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.13 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  25.05 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  25.05 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  25.67 
 
 		 442 aa  99.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  22.49 
 
 		 465 aa  99.8  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.51 
 
 		 441 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.96 
 
 		 441 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.23 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.34 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  24.88 
 
 		 461 aa  97.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24 
 
 		 475 aa  96.7  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.3 
 
 		 442 aa  96.7  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  28.16 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.1 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  26.07 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  25.96 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.63 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.46 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  29.1 
 
 		 472 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  27.29 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  28.14 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  25.3 
 
 		 445 aa  94  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  28.24 
 
 		 460 aa  94  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 527 aa  93.6  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 457 aa  93.2  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  25.21 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  25.21 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  25.21 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  25.21 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  25.21 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  26 
 
 		 443 aa  91.3  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  28.6 
 
 		 500 aa  90.9  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 439 aa  90.5  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.48 
 
 		 447 aa  90.5  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  29.58 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  20.36 
 
 		 454 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  28.03 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  31.45 
 
 		 480 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  24.12 
 
 		 468 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  20.36 
 
 		 454 aa  87.4  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3380  oligogalacturonide transporter  25.94 
 
 		 519 aa  87  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 432 aa  87  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  24.34 
 
 		 468 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  24.34 
 
 		 468 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  24.34 
 
 		 468 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>