93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2002 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 148 aa  304  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  81.76 
 
 		 219 aa  263  8.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  55.92 
 
 		 215 aa  168  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  55.92 
 
 		 215 aa  168  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  57.66 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  58.59 
 
 		 209 aa  150  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  55.86 
 
 		 201 aa  138  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  45.89 
 
 		 201 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  40.41 
 
 		 203 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  40.41 
 
 		 203 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  43.75 
 
 		 201 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  36.11 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  39.86 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  40.94 
 
 		 229 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  38.31 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  34.64 
 
 		 209 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  38.46 
 
 		 207 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  36.99 
 
 		 208 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  33.55 
 
 		 205 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  32.89 
 
 		 205 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  36.88 
 
 		 222 aa  87.8  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  38.57 
 
 		 222 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 215 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  34.23 
 
 		 195 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  35.66 
 
 		 213 aa  83.6  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  35.66 
 
 		 213 aa  83.6  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  34.23 
 
 		 207 aa  83.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  34.23 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  36.88 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  36.88 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  36.5 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  35.66 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  35.66 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  34.27 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  36.43 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  33.1 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  33.1 
 
 		 195 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  33.57 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  35 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  34.23 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  30.56 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  35.21 
 
 		 208 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  36.03 
 
 		 194 aa  70.1  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  36.03 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  35.29 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  36.03 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  36.45 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  36.03 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  30.97 
 
 		 219 aa  67  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  33.82 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  33.82 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  36.36 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  35.43 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  32.35 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  30.32 
 
 		 219 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  32.64 
 
 		 216 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  32.28 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  30.99 
 
 		 202 aa  62  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  35.61 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  35.61 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  31.25 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  37 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  35.71 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  32.12 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  26.17 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  36.14 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  29.13 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  36.51 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  27.4 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  34.18 
 
 		 484 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  34.18 
 
 		 484 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  34.52 
 
 		 295 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  34.15 
 
 		 215 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  46.94 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  36 
 
 		 154 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5846  transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 		 245 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2084  regulatory protein MerR  40.98 
 
 		 94 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  35.63 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1715  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 244 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.382422  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1425  putative resolvase  46.15 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  30.68 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 271 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1612  putative transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 		 351 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4320  hypothetical protein  37.66 
 
 		 293 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.264253 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  36.78 
 
 		 185 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>