More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4547 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  74.24 
 
 		 435 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  75.18 
 
 		 432 aa  653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  71.85 
 
 		 440 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  73.49 
 
 		 433 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  100 
 
 		 440 aa  885    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  68.38 
 
 		 452 aa  589  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  67.21 
 
 		 462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  66.59 
 
 		 434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  63.43 
 
 		 442 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  63.62 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  64.25 
 
 		 442 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  63.72 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  62.81 
 
 		 443 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  62.56 
 
 		 438 aa  522  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  59.15 
 
 		 434 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  60.93 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  63.26 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  63.53 
 
 		 444 aa  521  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  60.28 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  60.37 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  61.31 
 
 		 439 aa  511  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  63.89 
 
 		 444 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  62.56 
 
 		 445 aa  511  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  57.04 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  58.31 
 
 		 448 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  57.3 
 
 		 450 aa  488  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  59.73 
 
 		 444 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  59.73 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  59.73 
 
 		 444 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  59.68 
 
 		 451 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  56.97 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  57.11 
 
 		 446 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  59.67 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  55.06 
 
 		 421 aa  461  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  53.94 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  53.24 
 
 		 441 aa  455  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  53.09 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  51.95 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  51.17 
 
 		 434 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  54.8 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  51.65 
 
 		 468 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  52.14 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  35.81 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  31.67 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.01 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  30.28 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  33.8 
 
 		 497 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  29.09 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  28.89 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  28.18 
 
 		 468 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  26.98 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.18 
 
 		 472 aa  150  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  27.03 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  31.76 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  30.83 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  31.85 
 
 		 493 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  31.77 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  29.13 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  29.51 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  29.46 
 
 		 493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  25.94 
 
 		 485 aa  127  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  28.07 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  26.73 
 
 		 508 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.95 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  29.8 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  27.22 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  29.18 
 
 		 510 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  27.59 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.75 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  28.24 
 
 		 507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.71 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  28.24 
 
 		 507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.46 
 
 		 491 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  24.61 
 
 		 391 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  30.86 
 
 		 419 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.76 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  28.39 
 
 		 494 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  25.43 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  34.39 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.59 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  22.28 
 
 		 477 aa  100  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  27.11 
 
 		 374 aa  99.8  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  27.39 
 
 		 440 aa  99.8  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  25.21 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  31.08 
 
 		 373 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  24.54 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  26.21 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.98 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  28.8 
 
 		 380 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  26.37 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  25.07 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  25 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  22.82 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  23.16 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  23.47 
 
 		 423 aa  90.1  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.97 
 
 		 400 aa  89.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.74 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  26.15 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  26.67 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>