More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3426 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 
294 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  74.91 
 
 
285 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  72.7 
 
 
287 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  65.88 
 
 
296 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  65.52 
 
 
289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  61.19 
 
 
288 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  57.73 
 
 
303 aa  294  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  57.69 
 
 
273 aa  285  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  62.36 
 
 
334 aa  285  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  56.06 
 
 
360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  57.09 
 
 
288 aa  272  6e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 
283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  56.06 
 
 
282 aa  267  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  56.57 
 
 
321 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  51.15 
 
 
282 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  56.06 
 
 
282 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  54.37 
 
 
284 aa  261  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  57.78 
 
 
302 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  49.03 
 
 
281 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  58.78 
 
 
276 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  50.52 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  52.77 
 
 
289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  48.28 
 
 
280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  51.69 
 
 
291 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 
280 aa  248  9e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  49.06 
 
 
280 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  45.52 
 
 
289 aa  247  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  50.76 
 
 
283 aa  245  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  48.7 
 
 
539 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  47.22 
 
 
289 aa  241  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  50.74 
 
 
278 aa  241  7.999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  52.43 
 
 
304 aa  241  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  48.54 
 
 
283 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  52.17 
 
 
301 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  56.18 
 
 
296 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  52.73 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  50.7 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  51.5 
 
 
283 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  52.45 
 
 
327 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  53.53 
 
 
318 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 
282 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.36 
 
 
526 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  45.16 
 
 
280 aa  235  6e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
283 aa  234  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  50.58 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.23 
 
 
534 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  50.76 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  49.23 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  52.27 
 
 
279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  52.47 
 
 
288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  49.62 
 
 
279 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
283 aa  233  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  43.45 
 
 
283 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  52.85 
 
 
381 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  49.23 
 
 
281 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.95 
 
 
511 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  56.72 
 
 
324 aa  231  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  49.83 
 
 
282 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  43.68 
 
 
279 aa  231  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  45.25 
 
 
273 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  47.49 
 
 
281 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0555  pantoate--beta-alanine ligase  50.73 
 
 
278 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  50.57 
 
 
311 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
282 aa  229  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 
277 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.25 
 
 
529 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.93 
 
 
527 aa  228  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  52.53 
 
 
288 aa  228  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.24 
 
 
511 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 
283 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 
296 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  53.16 
 
 
313 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0644  pantoate--beta-alanine ligase  47.58 
 
 
283 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  53.16 
 
 
313 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  51.13 
 
 
282 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  48.26 
 
 
282 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.65 
 
 
528 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.16 
 
 
283 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12880  pantothenate synthetase  51.32 
 
 
291 aa  226  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00593935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  47.17 
 
 
289 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  48.88 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  45.77 
 
 
280 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  53.16 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  53.08 
 
 
302 aa  225  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.07 
 
 
287 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  48.13 
 
 
290 aa  225  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 
283 aa  225  8e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  45.28 
 
 
282 aa  224  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  48.25 
 
 
279 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0507  pantoate--beta-alanine ligase  47.08 
 
 
288 aa  224  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  49.64 
 
 
288 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  50.93 
 
 
291 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  53.72 
 
 
618 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1212  pantoate--beta-alanine ligase  46.82 
 
 
283 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0119566  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 
286 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  46.95 
 
 
290 aa  223  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  45.67 
 
 
281 aa  224  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  46.77 
 
 
281 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.07 
 
 
287 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  45.25 
 
 
280 aa  223  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>