83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2319 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  100 
 
 
456 aa  937    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  43.78 
 
 
470 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  40.92 
 
 
481 aa  351  2e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  40.92 
 
 
481 aa  348  8e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  37.73 
 
 
489 aa  325  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  39.04 
 
 
483 aa  324  3e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  37.92 
 
 
493 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  30.11 
 
 
573 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  29.38 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  29.31 
 
 
601 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  28.53 
 
 
853 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  26.63 
 
 
705 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  24.51 
 
 
590 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.73 
 
 
673 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  24.46 
 
 
1115 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  29.15 
 
 
869 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  22.35 
 
 
343 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 
847 aa  96.3  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  27.84 
 
 
863 aa  90.1  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  25.22 
 
 
498 aa  80.9  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  28.39 
 
 
486 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 
501 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  22.69 
 
 
561 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  27.27 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  24.47 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 
411 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.81 
 
 
370 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  25.2 
 
 
368 aa  64.3  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  23.23 
 
 
377 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  26.13 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  23.17 
 
 
551 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  25.88 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  29.79 
 
 
725 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  28.73 
 
 
831 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  21.53 
 
 
566 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  22.22 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  22.79 
 
 
365 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  22.5 
 
 
562 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  26.67 
 
 
526 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 
472 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  26.2 
 
 
438 aa  55.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0370  glycoside hydrolase family 5  29.03 
 
 
661 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.674387  normal  0.0657356 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26901  predicted protein  22.48 
 
 
1082 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0257796  normal  0.0277181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  28.34 
 
 
401 aa  53.9  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  21.68 
 
 
608 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  23.01 
 
 
347 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  21.25 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  23.79 
 
 
337 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  25.29 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1682  hypothetical protein  26.47 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446852  normal  0.0463851 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61452  glucan 1,3-beta-glucosidase  23.56 
 
 
506 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243086  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  24.93 
 
 
462 aa  50.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  27.82 
 
 
458 aa  50.1  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 
337 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  21.02 
 
 
633 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  24.11 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  21.68 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  27.63 
 
 
709 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  28.46 
 
 
431 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  21.25 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 
459 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  21.09 
 
 
597 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  24.17 
 
 
470 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  21.46 
 
 
814 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  22.27 
 
 
900 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  19.85 
 
 
332 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  21.07 
 
 
584 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0022  hypothetical protein  22.33 
 
 
386 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  21.56 
 
 
387 aa  47  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  24.4 
 
 
630 aa  46.6  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  18.28 
 
 
378 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  22.01 
 
 
365 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  21.67 
 
 
466 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  23.04 
 
 
638 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  29.63 
 
 
827 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  20.33 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  20.83 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  19.07 
 
 
343 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  19.41 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  25.11 
 
 
593 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  23.17 
 
 
480 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  22.84 
 
 
614 aa  43.1  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>