More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0908 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  55.05 
 
 		 201 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 209 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  29.47 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  30.41 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 269 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  26.58 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  26.84 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  28.05 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  23.86 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  24.28 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  33.65 
 
 		 278 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 248 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>